Accelerera och förstärka responsen på uppkomsten av nya luftvägsvirus.
Ett nätverk av virologilaboratorier som använder samma teknik för snabba, robusta och jämförbara resultat.
I syfte att stärka vår beredskap och respons vid en ny virusuppkomst och inom ramen för Discovery-studien skapades VIRvOLT, som står för Virology Operational Laboratories for Drug Testing, som en del av det europeiska projektet EU-RESPONSE. VIRvOLT, som utvecklats av CNR (National Reference Centre for Viruses of Respiratory Infections) vid Hospices Civils de Lyon (HCL-Frankrike), i samarbete med bioMérieux, är ett krisberedskapsverktyg som kompletterar det kliniska nätverket med virologilaboratorier på plats.
VIRvOLTs laboratorier kan snabbt mäta normaliserade virusmängder i luftvägsprover och ge jämförbara resultat oavsett vilken molekylär plattform som används. Tack vare VIRvOLT och vårt kontinuerliga arbete med att harmonisera tekniker kan vi bedöma den virala effekten av testade behandlingar vid varje given tidpunkt för mellanliggande eller slutliga resultat.
Elva europeiska virologilaboratorier har framgångsrikt slutfört valideringsprocessen och anslutit sig till VIRvOLT. De utför en extern kvalitetsbedömning och deltar i en arbetsgrupp en gång om året. Detta nätverk syftar till att integrera nya partners och har för närvarande kontakt med laboratorier i Irland, Norge och Italien.
Contacts
Nathalie Bergaud
Project manager
nathalie.bergaud01@chu-lyon.fr
Maude Bouscambert-Duchamp
Virologist
maude.bouscambert-duchamp@chu-lyon.fr
Alexandre Gaymard
Virologist
alexandre.gaymard@chu-lyon.fr
Nätverk av europeiska virologilaboratorier
VIRvOLT – Virologiska operativa laboratorier för drogtestning
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Brussels – Belgium
LHUB-ULB – Universitetssjukhusets laboratorium i Bryssel
LHUB-ULB:s mikrobiologiska avdelning ansvarar för laboratorieanalyser som utförs under förebyggande, diagnostisk och terapeutisk vård av patienter som lider av infektionssjukdomar. I detta sammanhang består vårt uppdrag av att leverera kvalitetsresultat inom en optimerad responstid genom att främja effektivitet, spetsteknik, expertis och tvärvetenskaplighet, samt starka interaktioner med klinikerna på våra partnersjukhus.
Mikrobiologiska avdelningen består av 6 kliniker och medicinska enheter och distribuerar sin verksamhet i vart och ett av våra 4 aktivitetscentra.
Mikrobiologiska avdelningen bedriver också expertverksamhet inom studier och övervakning av vissa infektioner i Belgien och är värd för 4 nationella referenscentra (Staphylococcus-arter, Campylobacter-arter, Haemophilus influenza och Legionella-arter). Han bedriver också forskningsprojekt inom områdena diagnos, epidemiologi och resistens mot antiinfektiva läkemedel.
Contacts: Benoit.PREVOST(at)LHUB-ULB.BE
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Brno – Czech Republic
Fakultetssjukhusets avdelning för klinisk mikrobiologi och immunologi
laboratoriediagnostik
- Molekylär mikrobiologi (Multiplex PCR – herpesvirus, luftvägssjukdomar, hjärnhinneinflammation, gastrointestinala sjukdomar, STD, HAV, HBV, HCV, HEV, Borrelia, andra)
- Bakteriologi, parasitologi, mykologi, antibiotikaresistens
- Infektionsimmunologi (antikroppsdetektion mot olika virala och bakteriella agens)
- Immunopatologi (detektion av antikroppar vid autoimmuna sjukdomar, allergier)
- BSL2-laboratorieenheter
Contacts: Kaevska.Marija(at)fnbrno.cz / ZdrazilovaDubska.Lenka(at)fnbrno.cz / Mrkvicova.Martina(at)fnbrno.cz
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Lyon – France
CNR – Nationellt referenscenter för virus av infektionssjukdomar
Utsett av hälsoministeriet, och mer specifikt av Generaldirektoratet för hälsovård (DGS) och av Santé Publique France (SPF), för att tillhandahålla expertis om influensa och andra luftvägsvirus
Del av Institutet för infektionsmedel (IAI):
- Mikrobiologisk expertis, bland annat virologisk expertis
- Molekylärbiologi, virusodling, serologi, serumneutralisering
- Tillgång till BSL 3-anläggningar
Uppdrag
Nationell övervakning av epidemiologi för luftvägsvirus baserad på flera nätverk som tillhandahåller prover som ska analyseras av CNR
- Allmänläkare
- Sjukhuslaboratorier
- Privata laboratorier
Nationell övervakning och hantering vid uppkomst
Virologists: maude.bouscambert-duchamp(at)chu-lyon.fr & alexandre.gaymard(at)chu-lyon.fr
Project Manager : nathalie.bergaud01(at)chu-lyon.fr
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Athens – Greece
Evaggelismos allmänna sjukhus, avdelningen för klinisk mikrobiologi
Avdelningen för klinisk mikrobiologi är ett sjukhuslaboratorium som tillhör Greklands största allmänna sjukhus i Aten (Evaggelismos allmänna sjukhus).
Avdelningen är indelad i underavdelningar:
- Avdelningen för klassisk bakteriologi (blododlingar, urinodlingar, andningsprovodlingar etc., MALDI-TOF-analys, mykologi, parasitologi)
- Serologiavdelningen (detektion av IgG, IgM, IgA och Ag med ELISA, IFA, CLIA etc.)
- Antibiotikaavdelningen
- Tuberkulosavdelningen
- Avdelningen för molekylärdiagnostik (detektion av luftvägsvirus, herpesvirus, polyomavirus, parvovirus B19 och protozoer som toxoplasma och leishmania, med molekylärbiologiska metoder. Molekylära epidemiologiska studier för detektion av resistens hos nosokomiala patogener)
Avdelningen är ett BSL-2-laboratorium och ingår i det nationella nätverket för diagnostisk testning av SARS-CoV-2.
Contact: ekraniot(at)yahoo.com
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
Pécs – Hungary
Pécs universitets kliniska center, institutionen för laboratoriemedicin – Enheten för molekylärgenetik
- Kliniskt rutindiagnostiskt laboratorium (den största leverantören av laboratoriediagnostiska tjänster i södra Transdanubien). Det finns mer än 250 typer av tester i vårt laboratorium, varav nästan 2,5 miljoner utförs årligen. Vårt institut är ett FJ-3-laboratorium som är i drift dygnet runt.
- Enheten för molekylärgenetik är ett BSL-2-laboratorium som sedan 2016 har ackrediterats för 15 molekylärdiagnostiska testarbetsflöden av den nationella ackrediteringsmyndigheten.
- Diagnostikpaletten inkluderar nukleinsyrabaserad diagnostisk testning av bakteriella och virala humana patogener och automatiserad serologitestning (HPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, hepatit B- och C-virus, HSV 1/2, CMV, EBV, PB19 och SARS-CoV-2 kvalitativ, kvantitativ och genotypanalys, SARS-CoV-2 anti-spike och anti-nukleokapsid IgM/IgG-detektion).
- Universitetet i Pécs har utvecklat bakteriologilaboratoriet (odling, serologi och MALDI-TOF-analys) vid institutionen för mikrobiologi.
- Laboratorieenheten är också ackrediterad för genetisk testning av faktor II och faktor V, MTHFR, APOE och multiresistensgenmutationer och polymorfismer (MDR).
- Ungerns nationella sjukförsäkringsfond (NEAK) utser laboratorieenheter för patogentestning, om det diagnostiska eller övervakningsbehovet för testning överstiger Nationella centrets centrala laboratoriekapacitet. Universitetet i Pécs har utsetts för diagnostik och övervakning av SARS-CoV-2 i den södra Transdanubiska regionen (3 län).
Contacts: gombos.katalin(at)pte.hu / urban.peter(at)pte.hu
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
Luxemburg
LNS – Laboratoire national de Santé – Institutionen för mikrobiologi
- Offentlig institution inrättad genom lag av den 7 augusti 2012 och verksam under överinseende av hälsoministeriet i Luxemburg
- Mångvetenskapligt institut med 4 avdelningar och 2 nationella centra:
- Nationellt centrum för patologi
- Nationellt centrum för genetik
- Medicinsk biologi
- Mikrobiologi
- Rättsmedicin
- Hälsoskydd
- Avdelningen för mikrobiologi: 3 tjänster
- Bakteriologi – mykologi – antibiotikaresistens och sjukhushygien
- Virologi och serologi
- Patogensekvensering: epidemiologisk och genomisk övervakning av patogener av allmänt intresse
- Avdelningen arbetar nära hälsoministeriet och ECDC för att stödja övervakning av patogener
- Avdelningen för mikrobiologi är nominerad till nationellt referenslaboratorium för akuta luftvägsinfektioner, HIV och viral hepatit
- Infrastruktur inom avdelningen: BSL-3
Contacts: Trung.Nguyen(at)lns.etat.lu / Megane.Migliorini(at)lns.etat.lu / Sabrina.Deroo(at)lns.etat.lu
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Łódź – Poland
Laboratoriet för luftvägsvirus vid medicinska universitetet i Łódź
Laboratoriet för luftvägsvirus vid medicinska universitetet i Łódź ligger i Łódź, Polen.
Vårt laboratorium har faciliteter för att utföra biomolekylära metoder.
Laboratoriet var ett av de första referenslaboratorierna i Polen som fick auktorisering för ett högkomplext molekylärt baserat SARS CoV-2-test som utvecklats av laboratoriet.
Tillsynsorganet på nationell nivå är Nationella hygieninstitutet, och vårt laboratorium är direkt underställt den ovan nämnda centrala institutionen.
Contacts: izabela.drozdz(at)umed.lodz.pl / maciej.borowiec(at)umed.lodz.pl
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Lisbon – Portugal
INSA – Nationellt referenslaboratorium för influensa och andra respiratoriska virus
Laboratoriediagnos
- Multiplex-PCR (influensa, SARS-CoV-2, respiratoriskt virus)
- Virusodling (influensa, SARS-CoV-2)
- Serologi: Influensa (hemaglutinationsinhibitionsanalys)
- SARS-CoV-2 (IgG anti-Spike, IgG anti-nukleokapsid, IgM; imunokemioluminescerande analys – Abbott)
- WGS influensa och SARS-CoV-2
- Antivirala känslighetsanalyser: Fenotypiska och genotypiska analyser
Laboratorieanläggningar
- BSL2 och BSL3
- Enhet för virusodling; Enhet för respiratoriska bakterier (TB, Legionela, Neisseria, Pneumo, Haemophilus)
Nationellt övervakningsprogram för influensa och andra respiratoriska virus
Contacts: isabel.carvalho(at)insa.min-saude.pt / raquel.guiomar(at)insa.min-saude.pt / Nuno.Verdasca(at)insa.min-saude.pt
CCL – CASSOVIA COVID LAB
Kosice – Slovakia
CCL – CASSOVIA COVID LAB
- Ackrediterat laboratorium för molekylärdiagnostik av COVID-19
- Universitetslaboratorium, BSL-2-laboratorium
- Del av det nationella nätverket för diagnostik av COVID-19
- Gemensam arbetsplats för 2 institutioner
- Avdelningen för epidemiologi
- Avdelningen för medicinsk och klinisk biokemi
- Andra diagnostiska metoder: serologi, serumneutraliseringstest – endast inom forskningsprojekt
- Bakteriologiska laboratoriet ligger vid institutionen för medicinsk och klinisk mikrobiologi
Contacts: monika.halanova(at)upjs.sk / miroslava.rabajdova(at)upjs.sk
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Madrid – Spain
Mikrobiologiska tjänster på sjukhuset La Paz
Universitetssjukhuset i La Paz är ett tertiärt vårdcenter i norra Madrid-området som tar emot över 58 000 inläggningar och vårdar över 1 500 000 öppenvårdspatienter per år. Sjukhusets avdelning för klinisk mikrobiologi och parasitologi är funktionellt uppdelad i flera enheter som inkluderar:
- Virologi
- Serologi
- Bakteriologi
- Mykologi
- Parasitologi
- Antibiotikakänslighetstestning
- Nästa generations sekvensering
- Molekylär mikrobiologisk forskning och utveckling
- BSL-3-labb
Avdelningen för klinisk mikrobiologi och parasitologi använder både klassiska och molekylära mikrobiologiska tekniker som inkluderar PCR, helgenomsekvensering och metagenomik. Avdelningen är också en del av det nationella övervakningsnätverket för luftvägsvirus, inklusive SARS-CoV-2.
Contacts: eliedahdouh(at)gmail.com
Clinical Virology – University Hospital Basel
Basel – Switzerland
Klinisk virologi – Universitetssjukhuset Basel
Uppdrag
Enheten för klinisk virologi vid Universitetssjukhuset Basel erbjuder ett omfattande utbud av analyser för att diagnostisera virussjukdomar hos människor. Vi är dedikerade till att utveckla och validera ny teknik och specialiserade analyser och samarbetar nära med kliniker och akademiska partners för att leverera tillförlitliga och banbrytande diagnostiska lösningar för infektionssjukdomar.
Nationellt övervaknings- och WHO-referenscenter
I vårt engagemang för folkhälsan engagerar vi oss aktivt i expertverksamhet och är värdar för WHO:s referenscenter för polio och enterovirus samt det nationella konfirmationscentret för HIV-diagnostisk testning. Vi är utsedda av Federal Office of Public Health Schweiz och erbjuder expertis inom influensa och andra luftvägsvirus, samt stödjer nationella övervaknings- och responsinsatser.
Laboratorieanläggningar och diagnostik
Våra laboratoriefunktioner omfattar ett brett utbud av diagnostiska metoder, såsom multiplex-PCR-testning, serologi, virusodling, antiviral känslighetstestning (fenotypisk och genotypisk), nästa generations sekvensering och tredje generationens nanopore-sekvensering. Genom att kombinera toppmodern teknik med vår expertis och starka samarbete med kliniska team och akademiska forskare strävar vi efter att leverera högkvalitativa diagnostiska tjänster och bidra till övervakning och forskning av infektionssjukdomar.
Contacts: karoline.leuzinger(a)usb.ch, rainer.gosert(a)usb.ch