Urýchlenie a posilnenie reakcie na nové respiračné vírusy.
Sieť virologických laboratórií využívajúcich rovnakú techniku pre rýchle, spoľahlivé a porovnateľné výsledky.
Na posilnenie našej pripravenosti a schopnosti reagovať na nové vírusy bol ako súčasť štúdie Discovery a európskeho projektu EU-RESPONSE vytvorený systém VIRvOLT (Virology Operational Laboratories for Drug Testing).
VIRvOLT, vyvinutý francúzskym Národným referenčným centrom (CNR) pre respiračné vírusové infekcie v Hospices Civils de Lyon (HCL, Francúzsko) v spolupráci so spoločnosťou bioMérieux, je strategickým nástrojom na prípravu na zdravotné krízy.
Teraz integrovaný do európskeho projektu PROACT EU-RESPONSE posilňuje existujúcu klinickú sieť pridaním lokálnych operačných virologických laboratórií.
Laboratóriá VIRvOLT umožňujú rýchle meranie štandardizovanej vírusovej záťaže vo vzorkách dýchacích ciest a poskytujú porovnateľné výsledky bez ohľadu na použitú molekulárnu platformu. Vďaka VIRvOLT a nášmu neustálemu úsiliu o harmonizáciu techník môžeme kedykoľvek posúdiť účinnosť testovaných liečebných postupov na vírus, a to z hľadiska priebežných alebo konečných výsledkov.
Jedenásť európskych virologických laboratórií úspešne dokončilo proces validácie a pripojilo sa k sieti VIRvOLT. Vykonávajú externé hodnotenie kvality a raz ročne sa zúčastňujú na práci pracovnej skupiny. Cieľom tejto siete je integrovať nových partnerov a v súčasnosti je v kontakte s laboratóriami v Írsku, Nórsku a Taliansku.
Contacts
Nathalie Bergaud
Project manager
nathalie.bergaud01@chu-lyon.fr
Maude Bouscambert-Duchamp
Virologist
maude.bouscambert-duchamp@chu-lyon.fr
Alexandre Gaymard
Virologist
alexandre.gaymard@chu-lyon.fr
Sieť európskych virologických laboratórií
VIRvOLT – Sieť operačnej virologickej laboratórií na hodnotenie liečby
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Brussels – Belgium
LHUB-ULB – Laboratórium univerzitnej nemocnice v Bruseli
Mikrobiologické oddelenie LHUB-ULB je zodpovedné za laboratórne analýzy vykonávané počas preventívnej, diagnostickej a terapeutickej starostlivosti o pacientov trpiacich infekčnými chorobami. V tejto súvislosti spočíva naša misia v poskytovaní kvalitných výsledkov v rámci optimalizovaného času odozvy prostredníctvom podpory efektívnosti, špičkových technológií, odborných znalostí a multidisciplinárnosti a silnej interakcie s klinickými pracovníkmi našich partnerských nemocníc.
Mikrobiologické oddelenie sa skladá zo 6 kliník a zdravotníckych jednotiek a svoje aktivity realizuje v každom zo 4 centier aktivít.
Mikrobiologické oddelenie vykonáva aj expertné činnosti v oblasti štúdia a sledovania určitých infekcií v Belgicku a je hostiteľom 4 národných referenčných centier (druhy Staphylococcus, Campylobacter, Haemophilus influenza a Legionella). Taktiež vykonáva výskumné projekty v oblasti diagnostiky, epidemiológie a rezistencie na antiinfekčné látky.
Contacts: Benoit.PREVOST(at)LHUB-ULB.BE
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Brno – Czech Republic
Katedra klinickej mikrobiológie a imunológie Fakultnej nemocnice
Laboratórna diagnostika
- Molekulárna mikrobiológia (Multiplex PCR – herpesvírusy, respiračné, meningitída, gastrointestinálne, pohlavne prenosné choroby, HAV, HBV, HCV, HEV, borélie, iné)
- Bakteriológia, parazitológia, mykológia, antibiotická rezistencia
- Infekčná imunológia (detekcia protilátok proti rôznym vírusovým a bakteriálnym agensom)
- Imunopatológia (detekcia protilátok pri autoimunitných ochoreniach, alergiách)
- BSL2 Laboratórne jednotky
Contacts: Kaevska.Marija(at)fnbrno.cz / ZdrazilovaDubska.Lenka(at)fnbrno.cz / Mrkvicova.Martina(at)fnbrno.cz
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Lyon – France
CNR – Národné referenčné centrum pre vírusy infekčných chorôb
Určené ministerstvom zdravotníctva, a najmä Generálnym riaditeľstvom zdravotníctva (DGS) a Santé Publique France (SPF), na poskytovanie odborných znalostí o chrípke a iných respiračných vírusoch
Súčasť Inštitútu pre infekčné agensy (IAI):
- Mikrobiologické odborné znalosti, vrátane virologických odborných znalostí
- Molekulárna biológia, vírusová kultúra, sérológia, neutralizácia séra
- Prístup k zariadeniam BSL 3
Misie
Národný dohľad nad epidemiológiou respiračných vírusov založený na niekoľkých sieťach poskytujúcich vzorky na analýzu CNR
- Všeobecní lekári
- Nemocničné laboratóriá
- Súkromné laboratóriá
Národný dohľad a manažment v prípade núdze
Virologists: maude.bouscambert-duchamp(at)chu-lyon.fr & alexandre.gaymard(at)chu-lyon.fr
Project Manager : nathalie.bergaud01(at)chu-lyon.fr
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Athens – Greece
Oddelenie klinickej mikrobiológie vo všeobecnej nemocnici Evaggelismos
Oddelenie klinickej mikrobiológie je nemocničné laboratórium patriace k najväčšej gréckej všeobecnej nemocnici v Aténach (Všeobecná nemocnica Evaggelismos).
Oddelenie je rozdelené na pododdelenia:
- Oddelenie klasickej bakteriológie (krvné kultúry, močové kultúry, kultúry respiračných vzoriek atď., MALDI-TOF analýza, mykológia, parazitológia)
- Oddelenie sérológie (detekcia IgG, IgM, IgA a Ag pomocou ELISA, IFA, CLIA atď.)
- Oddelenie antibiogramov
- Oddelenie tuberkulózy
- Oddelenie molekulárnej diagnostiky (detekcia respiračných vírusov, herpes vírusov, polyomavírusov, parvovírusu B19 a prvokov, ako sú Toxoplasma a Leishmania, metódami molekulárnej biológie. Molekulárno-epidemiologické štúdie na detekciu rezistencie u nozokomiálnych patogénov)
Oddelenie je laboratóriom BSL-2 a je súčasťou národnej siete pre diagnostické testovanie SARS-CoV-2.
Contact: ekraniot(at)yahoo.com
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
Pécs – Hungary
Klinické centrum Univerzity v Pécsi Oddelenie laboratórnej medicíny – Jednotka molekulárnej genetiky
- Klinické rutinné diagnostické laboratórium (najväčší poskytovateľ laboratórnych diagnostických služieb v regióne Južné Zadunajsko). V našom laboratóriu sa vykonáva viac ako 250 typov testov, z ktorých sa ročne vykoná takmer 2,5 milióna. Náš ústav je laboratórium FJ-3, ktoré pracuje nepretržite, 24 hodín denne.
- Oddelenie molekulárnej genetiky je laboratórium BSL-2, ktoré má od roku 2016 akreditovaný status pre 15 molekulárne diagnostických testovacích pracovných postupov od Národného akreditačného úradu.
- Diagnostická paleta zahŕňa diagnostické testovanie bakteriálnych a vírusových ľudských patogénov na báze nukleových kyselín a automatizované sérologické testovanie (kvalitatívna, kvantitatívna a genotypová analýza HPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, vírus hepatitídy B a C, HSV 1/2, CMV, EBV, PB19 a SARS-CoV-2, detekcia anti-spike a anti-nukleokapsidových IgM/IgG proti SARS-CoV-2).
- Univerzita v Péči vyvinula bakteriologické laboratórium (kultivácia, sérológia a MALDI-TOF analýza) na Katedre mikrobiológie.
- Laboratórna jednotka je tiež akreditovaná na genetické testovanie faktora II a faktora V, MTHFR, APOE a génových mutácií a polymorfizmov multiliekovej rezistencie (MDR).
- Maďarský národný fond zdravotného poistenia (NEAK) určuje laboratórne jednotky na testovanie patogénov, ak diagnostická alebo sledovacia potreba testovania presahuje centrálnu laboratórnu kapacitu Národného centra pre epidemiológiu. Univerzita v Péči je poverená diagnostikou a dohľadom nad SARS-CoV-2 v regióne Južného Zadunajska (3 okresy).
Contacts: gombos.katalin(at)pte.hu / urban.peter(at)pte.hu
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
Luxemburg
LNS – Národné zdravotné laboratórium – Oddelenie mikrobiológie
- Verejná inštitúcia založená zákonom zo 7. augusta 2012 a pôsobiaca pod dohľadom Ministerstva zdravotníctva v Luxembursku
- Multidisciplinárny inštitút so 4 oddeleniami a 2 národnými centrami:
- Národné centrum patológie
- Národné centrum genetiky
- Lekárska biológia
- Mikrobiológia
- Súdne lekárstvo
- Ochrana zdravia
- Oddelenie mikrobiológie: 3 služby
- Bakteriológia – mykológia – rezistencia na antibiotiká a nemocničná hygiena
- Virológia a sérológia
- Sekvenovanie patogénov: epidemiologické a genomické monitorovanie patogénov verejného záujmu
- Oddelenie úzko spolupracuje s Ministerstvom zdravotníctva (MZ) a ECDC na podpore dohľadu nad patogénmi
- Oddelenie mikrobiológie je nominované ako Národné referenčné laboratórium pre akútne respiračné infekcie, HIV a vírusovú hepatitídu
- Infraštruktúra v oddelení: BSL-3
Contacts: Trung.Nguyen(at)lns.etat.lu / Megane.Migliorini(at)lns.etat.lu / Sabrina.Deroo(at)lns.etat.lu
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Łódź – Poland
Laboratórium respiračných vírusov Lekárskej univerzity v Lodži
Laboratórium respiračných vírusov Lekárskej univerzity v Lodži sa nachádza v Lodži v Poľsku.
Naše laboratórium má vybavenie na vykonávanie biomolekulárnych metodík.
Laboratórium bolo jedným z prvých referenčných laboratórií v Poľsku, ktoré získalo autorizáciu na vysoko komplexný molekulárny test SARS CoV-2 vyvinutý v laboratóriu.
Dozorným orgánom na národnej úrovni je Národný ústav hygieny a naše laboratórium je priamo podriadené vyššie uvedenej ústrednej inštitúcii.
Contacts: izabela.drozdz(at)umed.lodz.pl / maciej.borowiec(at)umed.lodz.pl
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Lisbon – Portugal
INSA – Národné referenčné laboratórium pre chrípku a iné respiračné vírusy
Laboratórna diagnostika
- Multiplexná PCR (chrípka, SARS-CoV-2, respiračný vírus)
- Kultúra vírusu (chrípka, SARS-CoV-2)
- Sérológia: Chrípka (test inhibície hemaglutinácie)
- SARS-CoV-2 (IgG anti-Spike, IgG anti-nuklokapsid, IgM; imunochemioluminiscenčný test – Abbott)
- WGS Chrípka a SARS-CoV-2
- Testy citlivosti na antivírusové látky: Fenotypové a genotypové testy
Laboratórne zariadenia
- BSL2 a BSL3
- Jednotka vírusových kultúr; Jednotka respiračných baktérií (TB, Legionela, Neisseria, Pneumoniae, Haemophilus)
Národný program dohľadu nad chrípkou a inými respiračnými vírusmi
Contacts: isabel.carvalho(at)insa.min-saude.pt / raquel.guiomar(at)insa.min-saude.pt / Nuno.Verdasca(at)insa.min-saude.pt
CCL – CASSOVIA COVID LAB
Kosice – Slovakia
CCL – CASSOVIA COVID LAB
- Akreditované laboratórium molekulárnej diagnostiky COVID-19
- Univerzitné laboratórium, laboratórium BSL-2
- Súčasť národnej siete pre diagnostiku COVID-19
- Spoločné pracovisko 2 katedier
- Oddelenie epidemiológie
- Oddelenie lekárskej a klinickej biochémie
- Ďalšie diagnostické metódy: sérológia, sérový neutralizačný test – iba v rámci výskumných projektov
- Bakteriologické laboratórium sa nachádza na Katedre lekárskej a klinickej mikrobiológie
Contacts: monika.halanova(at)upjs.sk / miroslava.rabajdova(at)upjs.sk
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Madrid – Spain
Mikrobiologická služba, nemocnica La Paz
Univerzitná nemocnica La Paz je terciárne centrum starostlivosti v oblasti severného Madridu, ktoré ročne prijme viac ako 58 000 pacientov a stará sa o viac ako 1 500 000 ambulantných pacientov. Oddelenie klinickej mikrobiológie a parazitológie nemocnice je funkčne rozdelené do niekoľkých jednotiek, ktoré zahŕňajú:
- Virológia
- Sérológia
- Bakteriológia
- Mykológia
- Parazitológia
- Testovanie citlivosti na antibiotiká
- Sekvenovanie novej generácie
- Výskum a vývoj molekulárnej mikrobiológie
- Laboratórium BSL-3
Oddelenie klinickej mikrobiológie a parazitológie využíva klasické aj molekulárne mikrobiologické techniky, ktoré zahŕňajú PCR, sekvenovanie celého genómu a metagenomiku. Oddelenie je tiež súčasťou národnej siete dohľadu nad respiračnými vírusmi vrátane SARS-CoV-2.
Contacts: eliedahdouh(at)gmail.com
Clinical Virology – University Hospital Basel
Basel – Switzerland
Klinická virológia – Univerzitná nemocnica v Bazileji
Poslanie
Oddelenie klinickej virológie v Univerzitnej nemocnici v Bazileji ponúka komplexnú škálu analýz na diagnostiku vírusových ochorení u ľudí. Venujeme sa rozvoju a validácii nových technológií a špecializovaných testov a úzko spolupracujeme s klinickými lekármi a akademickými partnermi, aby sme poskytovali spoľahlivé a špičkové diagnostické riešenia pre infekčné choroby.
Národné centrum pre dohľad a referenčné centrum WHO
V rámci nášho záväzku voči verejnému zdraviu sa aktívne zapájame do expertných aktivít a sídlime v referenčných centrách WHO pre detskú obrnu a enterovírusy a Národnom potvrdzovacom centre pre diagnostické testovanie HIV. Ako odborníci z Federálneho úradu verejného zdravia Švajčiarska poskytujeme odborné znalosti v oblasti chrípky a iných respiračných vírusov a podporujeme národné úsilie v oblasti dohľadu a reakcie.
Laboratórne vybavenie a diagnostika
Naše laboratórne kapacity zahŕňajú širokú škálu diagnostických metód, ako je multiplexné PCR testovanie, sérológia, kultivácia vírusov, testovanie antivírusovej citlivosti (fenotypové a genotypové), sekvenovanie novej generácie a sekvenovanie Nanopore tretej generácie. Kombináciou
Contacts: karoline.leuzinger(a)usb.ch, rainer.gosert(a)usb.ch
