Paātrinot un pastiprinot reakciju uz jaunu elpceļu vīrusu parādīšanos.
Virusoloģijas laboratoriju tīkls, kas izmanto vienu un to pašu metodi ātru, stabilu un salīdzināmu rezultātu iegūšanai.
Lai stiprinātu mūsu sagatavotību un reaģēšanas spēju jauna vīrusa parādīšanās gadījumā un Discovery pētījuma ietvaros, Eiropas projekta EU-RESPONSE ietvaros tika izveidota VIRvOLT, kas apzīmē Viroloģijas operatīvās laboratorijas zāļu testēšanai. Lionas Civilās slimnīcas (HCL-France) CNR (Nacionālais elpceļu infekciju vīrusu references centrs) izstrādāja sadarbībā ar bioMérieux. VIRvOLT – tagad Eiropas projekta PROACT EU-RESPONSE rīcībā – ir krīzes gatavības rīks, kas papildina klīnisko tīklu ar virusoloģijas laboratorijām uz vietas.
VIRvOLT laboratorijas var ātri izmērīt normalizēto vīrusu slodzi elpceļu paraugos un sniegt salīdzināmus rezultātus neatkarīgi no izmantotās molekulārās platformas. Pateicoties VIRvOLT un mūsu nepārtrauktajam darbam metožu saskaņošanā, mēs jebkurā laikā varam novērtēt testēto ārstēšanas metožu vīrusu efektivitāti, lai noteiktu starpposma vai galīgos rezultātus.
Vienpadsmit Eiropas virusoloģijas laboratorijas ir veiksmīgi pabeigušas validācijas procesu un pievienojušās VIRvOLT. Tās veic ārējo kvalitātes novērtējumu un reizi gadā piedalās darba grupā. Šī tīkla mērķis ir integrēt jaunus partnerus, un pašlaik tas sazinās ar laboratorijām Īrijā, Norvēģijā un Itālijā.
Contacts
Nathalie Bergaud
Project manager
nathalie.bergaud01@chu-lyon.fr
Maude Bouscambert-Duchamp
Virologist
maude.bouscambert-duchamp@chu-lyon.fr
Alexandre Gaymard
Virologist
alexandre.gaymard@chu-lyon.fr
Eiropas virusoloģijas laboratoriju tīkls
VIRvOLT – Viroloģijas operatīvās laboratorijas zāļu testēšanai
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Brussels – Belgium
LHUB-ULB – Briseles Universitātes slimnīcu laboratorija
LHUB-ULB mikrobioloģijas nodaļa ir atbildīga par laboratorijas analīzēm, kas tiek veiktas pacientu, kuri cieš no infekcijas slimībām, profilaktiskās, diagnostiskās un terapeitiskās aprūpes laikā. Šajā kontekstā mūsu misija ir nodrošināt kvalitatīvus rezultātus optimizētā reaģēšanas laikā, veicinot efektivitāti, jaunākās tehnoloģijas, kompetenci un daudzdisciplinaritāti, kā arī ciešu mijiedarbību ar mūsu partnerslimnīcu klīnicistiem.
Mikrobioloģijas nodaļu veido 6 klīnikas un medicīnas vienības, un tā darbojas katrā no mūsu 4 darbības centriem.
Mikrobioloģijas nodaļa veic arī ekspertu darbības noteiktu infekciju izpētē un uzraudzībā Beļģijā un tajā atrodas 4 nacionālie references centri (Staphylococcus sugas, Campylobacter sugas, Haemophilus influenza un Legionella sugas). Tā arī vada pētniecības projektus diagnostikas, epidemioloģijas un pretinfekcijas līdzekļu rezistences jomā.
Contacts: Benoit.PREVOST(at)LHUB-ULB.BE
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Brno – Czech Republic
Fakultātes slimnīcas Klīniskās mikrobioloģijas un imunoloģijas katedra
Laboratoriskā diagnostika
- Molekulārā mikrobioloģija (multipleksā PCR – herpes vīrusi, elpceļu, meningīta, kuņģa-zarnu trakta, STS, HAV, HBV, HCV, HEV, borēlijas, citi).
- Bakterioloģija, parazitoloģija, mikoloģija, antibiotiku rezistence.
- Infekcijas imunoloģija (antivielu noteikšana pret dažādiem vīrusu un baktēriju izraisītājiem).
- Imunopatoloģija (antivielu noteikšana autoimūnu slimību, alerģiju gadījumā).
- BSL2 laboratorijas vienības
Contacts: Kaevska.Marija(at)fnbrno.cz / ZdrazilovaDubska.Lenka(at)fnbrno.cz / Mrkvicova.Martina(at)fnbrno.cz
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Lyon – France
CNR – Nacionālais references centrs infekcijas slimību vīrusiem
Veselības ministrijas, un jo īpaši Veselības ģenerāldirektorāta (DGS) un Santé Publique France (SPF), norīkots sniegt ekspertīzes gripas un citu elpceļu vīrusu jomā.
Infekcijas izraisītāju institūta (IAI) sastāvdaļa:
- Mikrobioloģiskā ekspertīze, tostarp virusoloģiskā ekspertīze.
- Molekulārā bioloģija, vīrusu kultūra, seroloģija, seruma neitralizācija.
- Piekļuve BSL 3 iekārtām.
Uzdevumi
Valsts mēroga elpceļu vīrusu epidemioloģijas uzraudzība, kuras pamatā ir vairāki tīkli, kas nodrošina paraugus. analizējams CNR
- Ģimenes ārsti
- Slimnīcu laboratorijas
- Privātās laboratorijas
Valsts mēroga uzraudzība un pārvaldība saslimšanas gadījumā
Virologists: maude.bouscambert-duchamp(at)chu-lyon.fr & alexandre.gaymard(at)chu-lyon.fr
Project Manager : nathalie.bergaud01(at)chu-lyon.fr
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Athens – Greece
Evaggelismos vispārējās slimnīcas klīniskās mikrobioloģijas nodaļa
Klīniskās mikrobioloģijas nodaļa ir slimnīcas laboratorija, kas pieder Grieķijas lielākajai vispārējai slimnīcai Atēnās (Evaggelismos vispārējā slimnīca).
Nodaļa ir sadalīta apakšnodaļās:
- Klasiskās bakterioloģijas nodaļa (asins kultūras, urīna kultūras, elpceļu paraugu kultūras u.c., MALDI-TOF analīze, mikoloģija, parazitoloģija)
- Seroloģijas nodaļa (IgG, IgM, IgA un Ag noteikšana ar ELISA, IFA, CLIA u.c.)
- Antibiogramu nodaļa
- Tuberkulozes nodaļa
- Molekulārās diagnostikas nodaļa (elpceļu vīrusu, herpes vīrusu, poliomas vīrusu, parvovīrusa B19 un protozoju, piemēram, toksoplazmas un leišmanijas, noteikšana ar molekulārās bioloģijas metodēm. Molekulārās epidemioloģijas pētījumi rezistences noteikšanai nosokomiālo patogēnu vidū)
Nodaļa ir BSL-2 laboratorija un ir daļa no valsts tīkla SARS-CoV-2 diagnostikas testēšanai
Contact: ekraniot(at)yahoo.com
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
Pécs – Hungary
Pēčas Universitātes Klīniskais centrs Laboratorijas medicīnas katedra – Molekulārās ģenētikas nodaļa
- Klīniskās rutīnas diagnostikas laboratorija (lielākais laboratorijas diagnostikas pakalpojumu sniedzējs Dienviddanubijas reģionā). Mūsu laboratorijā tiek veikti vairāk nekā 250 testu veidi, no kuriem gandrīz 2,5 miljoni tiek veikti katru gadu. Mūsu institūts ir FJ-3 laboratorija, kas darbojas nepārtraukti 24 stundas diennaktī.
- Molekulārās ģenētikas nodaļa ir BSL-2 laboratorija, kurai kopš 2016. gada ir Nacionālās akreditācijas iestādes akreditēts statuss 15 molekulārās diagnostikas testēšanas darbplūsmām.
- Diagnostikas palete ietver uz nukleīnskābēm balstītu bakteriālu un vīrusu cilvēka patogēnu diagnostisko testēšanu un automatizētu seroloģisko testēšanu (HPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, B un C hepatīta vīruss, HSV 1/2, CMV, EBV, PB19 un SARS-CoV-2 kvalitatīvā, kvantitatīvā un genotipa analīze, SARS-CoV-2 anti-spike un anti-nukleokapsīdu IgM/IgG noteikšana).
- Pēčas Universitāte Mikrobioloģijas katedrā izveidoja bakterioloģijas laboratoriju (kultivēšana, seroloģija un MALDI-TOF analīze).
- Laboratorijas vienība ir akreditēta arī II un V faktora, MTHFR, APOE un multirezistences gēnu mutāciju un polimorfismu (MDR) ģenētiskajai testēšanai.
- Ungārijas Nacionālais veselības apdrošināšanas fonds (NEAK) piešķir laboratorijas vienības patogēnu testēšanai, ja diagnostikas vai uzraudzības nepieciešamība testēšanai pārsniedz Nacionālā epidemioloģijas centra centrālās laboratorijas kapacitāti. Pēčas Universitāte ir iecelta par SARS-CoV-2 diagnostiku un uzraudzību Dienvidu Transdonāves reģionā (3 apgabalos).
Contacts: gombos.katalin(at)pte.hu / urban.peter(at)pte.hu
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
Luxemburg
LNS – Nacionālā veselības laboratorija – Mikrobioloģijas katedra
- Valsts iestāde, kas izveidota ar 2012. gada 7. augusta likumu un darbojas Luksemburgas Veselības ministrijas pārraudzībā.
- Daudznozaru institūts ar 4 katedrām un 2 nacionālajiem centriem:
- Nacionālais patoloģijas centrs
- Nacionālais ģenētikas centrs
- Medicīniskā bioloģija
- Mikrobioloģija
- Tiesu medicīna
- Veselības aizsardzība
- Mikrobioloģijas katedra: 3 pakalpojumi
- Bakterioloģija – mikoloģija – antibiotiku rezistence un slimnīcu higiēna
- Virusoloģija un seroloģija
- Patogēnu sekvencēšana: sabiedrības interešu patogēnu epidemioloģiskā un genomiskā uzraudzība.
- Departaments cieši sadarbojas ar Veselības ministriju (VM) un ECDC, lai atbalstītu patogēnu uzraudzību.
- Mikrobioloģijas katedra ir nominēta par Nacionālo references laboratoriju akūtu elpceļu infekciju, HIV un vīrusu hepatīta jomā.
- Departamenta infrastruktūra: BSL-3.
Contacts: Trung.Nguyen(at)lns.etat.lu / Megane.Migliorini(at)lns.etat.lu / Sabrina.Deroo(at)lns.etat.lu
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Łódź – Poland
Lodzas Medicīnas universitātes Elpošanas vīrusu laboratorija
Lodzas Medicīnas universitātes Elpošanas vīrusu laboratorija atrodas Lodza, Polija.
Mūsu laboratorijai ir iespēja veikt biomolekulārās metodoloģijas.
Laboratorija bija viena no pirmajām references laboratorijām Polijā, kas saņēma atļauju augstas sarežģītības molekulāram SARS CoV-2 laboratorijas izstrādātam testam.
Uzraudzības iestāde valsts līmenī ir Nacionālais higiēnas institūts, un mūsu laboratorija ir tieši pakļauta iepriekšminētajai centrālajai iestādei.
Contacts: izabela.drozdz(at)umed.lodz.pl / maciej.borowiec(at)umed.lodz.pl
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Lisbon – Portugal
INSA – Nacionālā references laboratorija gripas un citu elpceļu vīrusu jomā
Laboratoriskā diagnostika
- Multipleksa PCR (gripa, SARS-CoV-2, elpceļu vīruss)
- Vīrusu kultūra (gripa, SARS-CoV-2)
- Seroloģija: gripa (hemaglutinācijas inhibīcijas tests)
- SARS-CoV-2 (IgG anti-Spike, IgG anti-nuklokapsīds, IgM; imūnhemioluminescences tests – Abbott)
- WGS gripa un SARS-CoV-2
- Pretvīrusu jutības testi: fenotipiskie un genotipiskie testi
Laboratorijas aprīkojums
- BSL2 un BSL3
- Vīrusu kultūras vienība; Elpceļu baktēriju vienība (TB, Legionella, Neisseria, Pneumo, Haemophilus)
Nacionālā gripas un citu elpceļu vīrusu uzraudzības programma Vīrusi
Contacts: isabel.carvalho(at)insa.min-saude.pt / raquel.guiomar(at)insa.min-saude.pt / Nuno.Verdasca(at)insa.min-saude.pt
CCL – CASSOVIA COVID LAB
Kosice – Slovakia
CCL – CASSOVIA COVID LAB
- Akreditēta COVID-19 molekulārās diagnostikas laboratorija
- Universitātes laboratorija, BSL-2 laboratorija
- Daļa no valsts mēroga COVID-19 diagnostikas tīkla
- Divu katedru kopīga darba vieta
- Epidemioloģijas katedra
- Medicīniskās un klīniskās bioķīmijas katedra
- Citas diagnostikas metodes: seroloģija, seruma neitralizācijas tests – tikai pētniecības projektu ietvaros
- Bakterioloģijas laboratorija atrodas Medicīniskās un klīniskās mikrobioloģijas katedrā
Contacts: monika.halanova(at)upjs.sk / miroslava.rabajdova(at)upjs.sk
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Madrid – Spain
Lapasas slimnīcas mikrobioloģijas pakalpojums
Lapasas Universitātes slimnīca ir terciārās aprūpes centrs Madrides ziemeļu daļā, kas katru gadu uzņem vairāk nekā 58 000 pacientu un aprūpē vairāk nekā 1 500 000 ambulatoro pacientu. Slimnīcas Klīniskās mikrobioloģijas un parazitoloģijas nodaļa ir funkcionāli sadalīta vairākās vienībās, kas ietver:
- Virusoloģiju
- Seroloģiju
- Bakterioloģiju
- Mikoloģiju
- Parazitoloģiju
- Antibiotiku jutības testēšanu
- Nākamās paaudzes sekvencēšanu
- Molekulārās mikrobioloģijas pētniecību un attīstību
- BSL-3 laboratoriju
Klīniskās mikrobioloģijas un parazitoloģijas nodaļā tiek izmantotas gan klasiskās, gan molekulārās mikrobioloģijas metodes, tostarp PĶR, pilna genoma sekvencēšanu un metagenomiku. Nodaļa ir arī daļa no valsts elpceļu vīrusu, tostarp SARS-CoV-2, uzraudzības tīkla.
Contacts: eliedahdouh(at)gmail.com
Clinical Virology – University Hospital Basel
Basel – Switzerland
Klīniskā virusoloģija – Bāzeles Universitātes slimnīca
Misija
Bāzeles Universitātes slimnīcas Klīniskās virusoloģijas nodaļa piedāvā plašu analīžu klāstu vīrusu slimību diagnosticēšanai cilvēkiem. Veltījoties jaunu tehnoloģiju un specializētu testu attīstībai un validēšanai, mēs cieši sadarbojamies ar klīnicistiem un akadēmiskajiem partneriem, lai nodrošinātu uzticamus un modernus diagnostikas risinājumus infekcijas slimībām.
Nacionālais uzraudzības un PVO references centrs
Apņemoties rūpēties par sabiedrības veselību, mēs aktīvi iesaistāmies ekspertu darbībā, uzturot PVO references centrus poliomielīta un enterovīrusu jomā un Nacionālo apstiprināšanas centru HIV diagnostikas testēšanai. Šveices Federālā sabiedrības veselības biroja norīkots, mēs sniedzam zināšanas gripas un citu elpceļu vīrusu jomā, atbalstot valsts uzraudzības un reaģēšanas centienus.
Laboratorijas aprīkojums un diagnostika
Mūsu laboratorijas iespējas ietver plašu diagnostikas metožu klāstu, piemēram, multipleksu PCR testēšanu, seroloģiju, vīrusu kultūru, pretvīrusu jutības testēšanu (fenotipisko un genotipisko), nākamās paaudzes sekvencēšanu un trešās paaudzes nanoporu sekvencēšanu. Apvienojot jaunākās tehnoloģijas ar mūsu pieredzi un spēcīgu sadarbību ar klīniskajām komandām un akadēmiskajiem pētniekiem, mēs cenšamies sniegt augstas kvalitātes diagnostikas pakalpojumus un dot ieguldījumu infekcijas slimību uzraudzībā un pētniecībā.
Contacts: karoline.leuzinger(a)usb.ch, rainer.gosert(a)usb.ch