Spartesnis ir stipresnis atsakas į naujų kvėpavimo takų virusų atsiradimą.
Virusologijos laboratorijų tinklas, naudojantis tą pačią techniką, siekiant greitų, patikimų ir palyginamų rezultatų.
Siekiant sustiprinti mūsų pasirengimą ir reagavimą naujo viruso atsiradimo atveju ir vykdant „Discovery“ tyrimą, Europos projekto EU-RESPONSE dalis buvo sukurta VIRvOLT, reiškianti virusologijos operacines laboratorijas vaistų testavimui. Sukūrė Liono civilinių ligoninių CNR (Nacionalinis kvėpavimo takų infekcijų virusų referencinis centras) (HCL-France) kartu su „bioMérieux“. VIRvOLT, dabar priklausanti Europos projektui PROACT EU-RESPONSE, yra pasirengimo krizėms priemonė, papildanti klinikinį tinklą vietoje esančiomis virusologijos laboratorijomis.
VIRvOLT laboratorijos gali greitai išmatuoti normalizuotą virusų kiekį kvėpavimo takų mėginiuose ir pateikti palyginamus rezultatus, nepriklausomai nuo naudojamos molekulinės platformos. Dėl VIRvOLT ir mūsų nuolatinio darbo derinant metodus, bet kuriuo metu galime įvertinti išbandytų gydymo būdų virusinį veiksmingumą, siekdami tarpinių ar galutinių rezultatų.
Vienuolika Europos virusologijos laboratorijų sėkmingai baigė patvirtinimo procesą ir prisijungė prie VIRvOLT. Jos atlieka išorinį kokybės vertinimą ir kartą per metus dalyvauja darbo grupės veikloje. Šis tinklas siekia integruoti naujus partnerius ir šiuo metu palaiko ryšį su laboratorijomis Airijoje, Norvegijoje ir Italijoje.
Contacts
Nathalie Bergaud
Project manager
nathalie.bergaud01@chu-lyon.fr
Maude Bouscambert-Duchamp
Virologist
maude.bouscambert-duchamp@chu-lyon.fr
Alexandre Gaymard
Virologist
alexandre.gaymard@chu-lyon.fr
Europos virusologijos laboratorijų tinklas
VIRvOLT – Virusologijos operacinės laboratorijos vaistų testavimui
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Brussels – Belgium
LHUB-ULB – Briuselio universiteto ligoninės laboratorija
LHUB-ULB mikrobiologijos skyrius yra atsakingas už laboratorinius tyrimus, atliekamus teikiant profilaktines, diagnostines ir terapines paslaugas pacientams, sergantiems infekcinėmis ligomis. Šiame kontekste mūsų misija – pateikti kokybiškus rezultatus per optimizuotą reagavimo laiką, skatinant efektyvumą, pažangiausias technologijas, kompetenciją ir daugiadiscipliniškumą bei glaudžiai bendradarbiaujant su mūsų partnerių ligoninių gydytojais.
Mikrobiologijos skyrių sudaro 6 klinikos ir medicinos padaliniai, o veikla vykdoma kiekviename iš 4 mūsų veiklos centrų.
Mikrobiologijos skyrius taip pat vykdo ekspertinę veiklą tiriant ir stebint tam tikras infekcijas Belgijoje ir jame veikia 4 nacionaliniai referenciniai centrai (Staphylococcus rūšys, Campylobacter rūšys, Haemophilus influenza ir Legionella rūšys). Jis taip pat vykdo mokslinių tyrimų projektus diagnostikos, epidemiologijos ir atsparumo antiinfekciniams vaistams srityse.
Contacts: Benoit.PREVOST(at)LHUB-ULB.BE
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Brno – Czech Republic
Fakulteto ligoninės Klinikinės mikrobiologijos ir imunologijos katedra
Laboratorinė diagnostika
- Molekulinė mikrobiologija (daugialypė PGR – herpeso virusai, kvėpavimo takų, meningito, virškinimo trakto, lytiškai plintančių ligų, HAV, HBV, HCV, HEV, borelijų, kitų)
- Bakteriologija, parazitologija, mikologija, atsparumas antibiotikams
- Infekcinė imunologija (antikūnų prieš įvairius virusinius ir bakterinius sukėlėjus nustatymas)
- Imunopatologija (antikūnų nustatymas autoimuninėse ligose, alergijose)
- BSL2 laboratoriniai vienetai
Contacts: Kaevska.Marija(at)fnbrno.cz / ZdrazilovaDubska.Lenka(at)fnbrno.cz / Mrkvicova.Martina(at)fnbrno.cz
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Lyon – France
CNR – Nacionalinis infekcinių ligų virusų referencinis centras
Sveikatos apsaugos ministerijos, o ypač Sveikatos generalinio direktorato (DGS) ir Prancūzijos viešosios tarnybos (SPF), paskirtas teikti ekspertizes gripo ir kitų kvėpavimo takų virusų srityje
Infekcinių sukėlėjų instituto (IAI) dalis:
- Mikrobiologinė ekspertizė, įskaitant virusologinę
- Molekulinė biologija, virusų kultūra, serologija, serumo neutralizavimas
- Prieiga prie BSL 3 įrenginių
Užduotys
Nacionalinė kvėpavimo takų virusų epidemiologijos stebėsena, pagrįsta keliais tinklais, teikiančiais mėginius CNR analizei
- Bendrosios praktikos gydytojai
- Ligoninių laboratorijos
- Privačios laboratorijos
Nacionalinė stebėsena ir valdymas užsikrėtimo atveju
Virologists: maude.bouscambert-duchamp(at)chu-lyon.fr & alexandre.gaymard(at)chu-lyon.fr
Project Manager : nathalie.bergaud01(at)chu-lyon.fr
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Athens – Greece
Evaggelismos bendrosios ligoninės klinikinės mikrobiologijos skyrius
Klinikinės mikrobiologijos skyrius yra ligoninės laboratorija, priklausanti didžiausiai Graikijos bendrosios ligoninės Atėnuose (Evaggelismos bendrosios ligoninės) laboratorijai.
Skyrius yra padalintas į poskyrius:
- Klasikinės bakteriologijos skyrius (kraujo kultūros, šlapimo kultūros, kvėpavimo takų mėginių kultūros ir kt., MALDI-TOF analizė, mikologija, parazitologija)
- Serologijos skyrius (IgG, IgM, IgA ir Ag nustatymas ELISA, IFA, CLIA ir kt. metodais)
- Antibiogramų skyrius
- Tuberkuliozės skyrius
- Molekulinės diagnostikos skyrius (kvėpavimo takų virusų, herpeso virusų, poliomos virusų, parvoviruso B19 ir pirmuonių, tokių kaip toksoplazma ir leišmanijos, nustatymas molekulinės biologijos metodais. Molekulinės epidemiologijos tyrimai, skirti nosokominių patogenų atsparumui nustatyti)
Skyrius yra BSL-2 laboratorija ir yra nacionalinio SARS-CoV-2 diagnostinių tyrimų tinklo dalis.
Contact: ekraniot(at)yahoo.com
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
Pécs – Hungary
Pėčo universiteto klinikinis centras Laboratorinės medicinos katedra – Molekulinės genetikos skyrius
- Klinikinės įprastinės diagnostikos laboratorija (didžiausia laboratorinės diagnostikos paslaugų teikėja Pietų Danubės regione). Mūsų laboratorijoje atliekama daugiau nei 250 rūšių tyrimų, iš kurių kasmet atliekama beveik 2,5 milijono. Mūsų institutas yra FJ-3 laboratorija, dirbanti visą parą.
- Molekulinės genetikos skyrius yra BSL-2 laboratorija, nuo 2016 m. Nacionalinės akreditacijos tarnybos akredituota 15 molekulinės diagnostikos tyrimų darbo eigų.
- Diagnostikos paletę sudaro nukleorūgščių pagrindu atliekami bakterinių ir virusinių žmogaus patogenų diagnostiniai tyrimai ir automatiniai serologiniai tyrimai (ŽPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, hepatito B ir C virusas, HSV 1/2, CMV, EBV, PB19 ir SARS-CoV-2 kokybinė, kiekybinė ir genotipo analizė, SARS-CoV-2 anti-spike ir anti-nukleokapsidinių IgM/IgG nustatymas).
- Pečo universitetas Mikrobiologijos katedroje įkūrė bakteriologijos laboratoriją (kultivavimas, serologija ir MALDI-TOF analizė).
- Laboratorinis padalinys taip pat yra akredituotas II ir V faktorių, MTHFR, APOE ir daugelio vaistų atsparumo genų mutacijų ir polimorfizmų (MDR) genetiniams tyrimams.
- Vengrijos nacionalinis sveikatos draudimo fondas (NEAK) skiria laboratorinius padalinius patogenų tyrimams, jei diagnostikos ar priežiūros tyrimų poreikis viršija Nacionalinio epidemiologijos centro centrinės laboratorijos pajėgumus. Pėčo universitetas paskirtas SARS-CoV-2 diagnostikai ir stebėsenai Pietų Padunojaus regione (3 apskrityse).
Contacts: gombos.katalin(at)pte.hu / urban.peter(at)pte.hu
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
Luxemburg
LNS – Nacionalinė sveikatos laboratorija – Mikrobiologijos katedra
- Viešoji įstaiga, įsteigta 2012 m. rugpjūčio 7 d. įstatymu ir veikianti Liuksemburgo Sveikatos apsaugos ministerijos priežiūroje
- Daugiadisciplininis institutas su 4 katedromis ir 2 nacionaliniais centrais:
- Nacionalinis patologijos centras
- Nacionalinis genetikos centras
- Medicinos biologija
- Mikrobiologija
- Teismo medicina
- Sveikatos apsauga
- Mikrobiologijos katedra: 3 paslaugos
- Bakteriologija – mikologija – atsparumas antibiotikams ir ligoninės higiena
- Virusologija ir serologija
- Patogenų sekvenavimas: visuomenės interesų patogenų epidemiologinė ir genominė stebėsena
- Kategorė glaudžiai bendradarbiauja su Sveikatos apsaugos ministerija (SAM) ir ECDC, siekdama paremti patogenų stebėseną
- Mikrobiologijos katedra nominuota Nacionaline ūminių kvėpavimo takų infekcijų, ŽIV ir virusinio hepatito referencine laboratorija
- Kategorės infrastruktūra: BSL-3
Contacts: Trung.Nguyen(at)lns.etat.lu / Megane.Migliorini(at)lns.etat.lu / Sabrina.Deroo(at)lns.etat.lu
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Łódź – Poland
Lodzės medicinos universiteto kvėpavimo takų virusų laboratorija
Lodzės medicinos universiteto kvėpavimo takų virusų laboratorija yra Lodzėje, Lenkijoje.
Mūsų laboratorija turi patalpas biomolekuliniams metodologijoms atlikti.
Laboratorija buvo viena pirmųjų referencinių laboratorijų Lenkijoje, gavusių leidimą atlikti didelio sudėtingumo molekulinį SARS CoV-2 laboratorijos sukurtą testą.
Nacionalinio lygmens priežiūros institucija yra Nacionalinis higienos institutas, o mūsų laboratorija yra tiesiogiai pavaldi minėtai centrinei institucijai.
Contacts: izabela.drozdz(at)umed.lodz.pl / maciej.borowiec(at)umed.lodz.pl
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Lisbon – Portugal
INSA – Nacionalinė gripo ir kitų kvėpavimo takų virusų referencinė laboratorija
Laboratorinė diagnostika
- Daugialypis PGR tyrimas (gripas, SARS-CoV-2, kvėpavimo takų virusas).
- Virusų kultūra (gripas, SARS-CoV-2).
- Serologija: gripas (hemaglutinacijos slopinimo tyrimas).
- SARS-CoV-2 (IgG anti-Spike, IgG anti-nukleokapsidas, IgM; imunochemioluminescencinis tyrimas – Abbott).
- WGS gripas ir SARS-CoV-2.
- Antivirusinių vaistų jautrumo tyrimai: fenotipiniai ir genotipiniai tyrimai.
Laboratorinė įranga
- BSL2 ir BSL3.
- Virusų kultūros skyrius; kvėpavimo takų bakterijų skyrius (TB, Legionela, Neisseria, Pneumo, Haemophilus).
Nacionalinė gripo ir kitų kvėpavimo takų virusų stebėjimo programa.
Contacts: isabel.carvalho(at)insa.min-saude.pt / raquel.guiomar(at)insa.min-saude.pt / Nuno.Verdasca(at)insa.min-saude.pt
CCL – CASSOVIA COVID LAB
Kosice – Slovakia
CCL – CASSOVIA COVID LAB
- Akredituota COVID-19 molekulinės diagnostikos laboratorija
- Universiteto laboratorija, BSL-2 laboratorija
- Nacionalinio COVID-19 diagnostikos tinklo dalis
- Bendra 2 katedrų darbo vieta
- Epidemiologijos katedra
- Medicininės ir klinikinės biochemijos katedra
- Kiti diagnostikos metodai: serologija, serumo neutralizacijos testas – tik mokslinių tyrimų projektuose
- Bakteriologijos laboratorija yra Medicininės ir klinikinės mikrobiologijos katedroje
Contacts: monika.halanova(at)upjs.sk / miroslava.rabajdova(at)upjs.sk
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Madrid – Spain
La Pazo ligoninės mikrobiologijos paslaugos
La Pazo universitetinė ligoninė yra tretinio lygio priežiūros centras šiauriniame Madrido regione, kuris per metus priima daugiau nei 58 000 pacientų ir rūpinasi daugiau nei 1 500 000 ambulatorinių pacientų. Ligoninės Klinikinės mikrobiologijos ir parazitologijos skyrius yra funkciškai suskirstytas į kelis padalinius, įskaitant:
- Virusologiją
- Serologiją
- Bakteriologiją
- Mikologiją
- Parazitologiją
- Antibiotikų jautrumo tyrimus
- Naujos kartos sekvenavimą
- Molekulinės mikrobiologijos tyrimus ir plėtrą
- BSL-3 laboratoriją
Klinikinės mikrobiologijos ir parazitologijos skyrius taiko tiek klasikinius, tiek molekulinės mikrobiologijos metodus, įskaitant PGR, viso genomo sekvenavimą ir metagenomiką. Skyrius taip pat yra nacionalinio kvėpavimo takų virusų, įskaitant SARS-CoV-2, stebėjimo tinklo dalis.
Contacts: eliedahdouh(at)gmail.com
Clinical Virology – University Hospital Basel
Basel – Switzerland
Klinikinė virusologija – Bazelio universitetinė ligoninė
Misija
Bazelio universitetinės ligoninės Klinikinės virusologijos skyrius siūlo platų spektrą analizių, skirtų virusinėms ligoms diagnozuoti žmonėms. Atsidavę naujų technologijų ir specializuotų tyrimų tobulinimui ir patvirtinimui, glaudžiai bendradarbiaujame su klinikiniais specialistais ir akademiniais partneriais, kad pateiktume patikimus ir pažangiausius infekcinių ligų diagnostikos sprendimus.
Nacionalinis stebėjimo ir PSO referencinis centras
Rūpindamiesi visuomenės sveikata, aktyviai dalyvaujame ekspertų veikloje, įkurdami PSO poliomielito ir enterovirusų referencinius centrus bei Nacionalinį ŽIV diagnostinių tyrimų patvirtinimo centrą. Šveicarijos federalinės visuomenės sveikatos tarnybos paskirti specialistai teikia gripo ir kitų kvėpavimo takų virusų srities ekspertizes, remdami nacionalinę stebėjimo ir reagavimo pastangas.
Laboratorinė įranga ir diagnostika
Mūsų laboratorijos galimybės apima platų diagnostinių metodų spektrą, pavyzdžiui, daugybinius PGR tyrimus, serologiją, virusų kultūrą, antivirusinių vaistų jautrumo tyrimus (fenotipinius ir genotipinius), naujos kartos sekvenavimą ir trečios kartos nanoporų sekvenavimą. Sujungdami
Contacts: karoline.leuzinger(a)usb.ch, rainer.gosert(a)usb.ch