Ubrzavanje i jačanje odgovora na pojavu novih respiratornih virusa.
Mreža viroloških laboratorija koji koriste istu tehniku za brze, robusne i usporedive rezultate.
S ciljem jačanja naše spremnosti i sposobnosti reagiranja u slučaju pojave novog virusa i u okviru ispitivanja Discovery, kao dio europskog projekta EU-RESPONSE, stvoren je VIRvOLT, što je kratica za Virološke operativne laboratorije za testiranje lijekova. Razvio ga je CNR (Nacionalni referentni centar za viruse respiratornih infekcija) Hospices Civils de Lyon (HCL-Francuska), u partnerstvu s bioMérieuxom, VIRvOLT – sada na raspolaganju europskom projektu PROACT EU-RESPONSE – alat je za pripravnost na krize koji nadopunjuje kliničku mrežu s virološkim laboratorijima na licu mjesta.
Laboratoriji VIRvOLT-a mogu brzo izmjeriti normalizirano virusno opterećenje u respiratornim uzorcima i pružiti usporedive rezultate bez obzira na korištenu molekularnu platformu. Zahvaljujući VIRvOLT-u i našem kontinuiranom radu na usklađivanju tehnika, možemo procijeniti virusnu učinkovitost testiranih tretmana u bilo kojem trenutku za međuvremenske ili konačne ishode.
Jedanaest europskih viroloških laboratorija uspješno je završilo proces validacije i pridružilo se VIRvOLT-u. Provode vanjsku procjenu kvalitete i sudjeluju u radnoj skupini jednom godišnje. Cilj ove mreže je integrirati nove partnere i trenutno je u kontaktu s laboratorijima u Irskoj, Norveškoj i Italiji.
Contacts
Nathalie Bergaud
Project manager
nathalie.bergaud01@chu-lyon.fr
Maude Bouscambert-Duchamp
Virologist
maude.bouscambert-duchamp@chu-lyon.fr
Alexandre Gaymard
Virologist
alexandre.gaymard@chu-lyon.fr
Mreža europskih viroloških laboratorija
VIRvOLT – Virološki operativni laboratoriji za testiranje lijekova
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Brussels – Belgium
LHUB-ULB – Sveučilišni bolnički laboratorij u Bruxellesu
Mikrobiološki odjel LHUB-ULB-a odgovoran je za laboratorijske analize koje se provode tijekom preventivne, dijagnostičke i terapijske skrbi pacijenata koji boluju od zaraznih bolesti. U tom kontekstu, naša misija sastoji se od pružanja kvalitetnih rezultata u optimiziranom vremenu odziva promicanjem učinkovitosti, najsuvremenijih tehnologija, stručnosti i multidisciplinarnosti te snažne interakcije s kliničarima naših partnerskih bolnica.
Mikrobiološki odjel sastoji se od 6 klinika i medicinskih jedinica te provodi svoje aktivnosti u svakom od naša 4 centra aktivnosti.
Mikrobiološki odjel također provodi stručne aktivnosti u proučavanju i nadzoru određenih infekcija u Belgiji i domaćin je 4 nacionalna referentna centra (vrste Staphylococcus, vrste Campylobacter, Haemophilus influenza ivrste Legionella). Također provodi istraživačke projekte u područjima dijagnoze, epidemiologije i otpornosti na antiinfektivne lijekove.
Contacts: Benoit.PREVOST(at)LHUB-ULB.BE
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Brno – Czech Republic
Fakultetska bolnica Zavod za kliničku mikrobiologiju i imunologiju
Laboratorijska dijagnostika
- Molekularna mikrobiologija (Multipleks PCR – herpes virusi, respiratorni, meningitis, gastrointestinalni, spolno prenosive bolesti, HAV, HBV, HCV, HEV, borelije, ostali)
- Bakteriologija, parazitologija, mikologija, otpornost na antibiotike
- Infektivna imunologija (otkrivanje antitijela protiv različitih virusnih i bakterijskih uzročnika)
- Imunopatologija (otkrivanje antitijela kod autoimunih bolesti, alergija)
- BSL2 Laboratorijske jedinice
Contacts: Kaevska.Marija(at)fnbrno.cz / ZdrazilovaDubska.Lenka(at)fnbrno.cz / Mrkvicova.Martina(at)fnbrno.cz
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Lyon – France
CNR – Nacionalni referentni centar za viruse zaraznih bolesti
Određen od strane Ministarstva nadležnog za zdravstvo, a posebno od strane Opće uprave za zdravstvo (DGS) i Santé Publique France (SPF), za pružanje stručnosti o gripi i drugim respiratornim virusima
Dio Instituta za zarazne agense (IAI):
- Mikrobiološka stručnost, uključujući virološku stručnost
- Molekularna biologija, virusna kultura, serologija, neutralizacija seruma
- Pristup objektima BSL 3
Misije
Nacionalni nadzor epidemiologije respiratornih virusa temeljen na nekoliko mreža koje pružaju uzorke za analizu od strane CNR-a
- Liječnici opće prakse
- Bolnički laboratoriji
- Privatni laboratoriji
Nacionalni nadzor i upravljanje u slučaju izbijanja bolesti
Virologists: maude.bouscambert-duchamp(at)chu-lyon.fr & alexandre.gaymard(at)chu-lyon.fr
Project Manager : nathalie.bergaud01(at)chu-lyon.fr
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Athens – Greece
Odjel za kliničku mikrobiologiju Opće bolnice Evaggelismos
Odjel za kliničku mikrobiologiju je bolnički laboratorij koji pripada najvećoj grčkoj općoj bolnici u Ateni (Opća bolnica Evaggelismos).
Odjel je podijeljen na pododjele:
- Odjel za klasičnu bakteriologiju (krvne kulture, kulture urina, kulture respiratornih uzoraka itd., MALDI-TOF analiza, mikologija, parazitologija)
- Odjel za serologiju (detekcija IgG, IgM, IgA i Ag pomoću ELISA, IFA, CLIA itd.)
- Odjel za antibiograme
- Odjel za tuberkulozu
- Odjel za molekularnu dijagnostiku (detekcija respiratornih virusa, herpes virusa, poliomavirusa, parvovirusa B19 i protozoa poput toksoplazme i lišmanije, metodama molekularne biologije. Molekularno epidemiološke studije za detekciju rezistencije kod nozokomijalnih patogena)
Odjel je laboratorij BSL-2 i dio je nacionalne mreže za dijagnostičko testiranje SARS-CoV-2
Contact: ekraniot(at)yahoo.com
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
Pécs – Hungary
Klinički centar Sveučilišta u Pečuhu Odjel za laboratorijsku medicinu – Jedinica za molekularnu genetiku
- Klinički rutinski dijagnostički laboratorij (najveći pružatelj usluga laboratorijske dijagnostike u regiji Južnog Podunavlja) U našem laboratoriju postoji više od 250 vrsta testova, od kojih se godišnje obavi gotovo 2,5 milijuna. Naš institut je laboratorij FJ-3, koji radi neprekidno, 24 sata dnevno.
- Jedinica za molekularnu genetiku je laboratorij BSL-2 koji od 2016. godine ima akreditirani status za 15 molekularno-dijagnostičkih tijekova testiranja od strane Nacionalnog akreditacijskog tijela.
- Dijagnostička paleta uključuje dijagnostičko testiranje bakterijskih i virusnih ljudskih patogena na bazi nukleinskih kiselina i automatizirano serološko testiranje (HPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, virus hepatitisa B i C, HSV 1/2, CMV, EBV, PB19 i SARS-CoV-2 kvalitativna, kvantitativna i genotipska analiza, detekcija SARS-CoV-2 anti-spike i antinukleokapsidnih IgM/IgG).
- Sveučilište u Pečuhu razvilo je bakteriološki laboratorij (kultivacija, serologija i MALDI-TOF analiza) u Odjelu za mikrobiologiju.
- Laboratorijska jedinica je također akreditirana za genetsko testiranje faktora II i faktora V, MTHFR, APOE te mutacija i polimorfizama gena za višestruku rezistenciju na lijekove (MDR).
- Mađarski nacionalni fond za zdravstveno osiguranje (NEAK) imenuje laboratorijske jedinice za testiranje patogena, ako dijagnostička ili nadzorna potreba za testiranjem premašuje kapacitet središnjeg laboratorija Nacionalnog centra za epidemiologiju. Sveučilište u Pečuhu imenovano je za dijagnostiku i nadzor SARS-CoV-2 za južno-podunavsku regiju (3 županije).
Contacts: gombos.katalin(at)pte.hu / urban.peter(at)pte.hu
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
Luxemburg
LNS – Nacionalni laboratorij za zdravlje – Odjel za mikrobiologiju
- Javna ustanova osnovana zakonom od 7. kolovoza 2012. koja djeluje pod nadzorom Ministarstva zdravstva u Luksemburgu
- Multidisciplinarni institut s 4 odjela i 2 nacionalna centra:
- Nacionalni centar za patologiju
- Nacionalni centar za genetiku
- Medicinska biologija
- Mikrobiologija
- Sudska medicina
- Zaštita zdravlja
- Odjel za mikrobiologiju: 3 službe
- Bakteriologija – mikologija – otpornost na antibiotike i bolnička higijena
- Virologija i serologija
- Sekvenciranje patogena: epidemiološko i genomsko praćenje patogena od javnog interesa
- Odjel blisko surađuje s Ministarstvom zdravstva (MoH) i ECDC-om kako bi podržao nadzor patogena
- Odjel za mikrobiologiju nominiran je za Nacionalni referentni laboratorij za akutne respiratorne infekcije, HIV i virusni hepatitis
- Infrastruktura u odjelu: BSL-3
Contacts: Trung.Nguyen(at)lns.etat.lu / Megane.Migliorini(at)lns.etat.lu / Sabrina.Deroo(at)lns.etat.lu
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Łódź – Poland
Laboratorij za respiratorne viruse Medicinskog sveučilišta u Łódźu
Laboratorij za respiratorne viruse Medicinskog sveučilišta u Łódźu nalazi se u Łódźu u Poljskoj.
Naš laboratorij ima kapacitete za provođenje biomolekularnih metodologija.
Laboratorij je bio jedan od prvih referentnih laboratorija u Poljskoj koji je dobio ovlaštenje za visokosloženi molekularno zasnovani test SARS CoV-2 razvijen u laboratoriju.
Nadzorno tijelo na nacionalnoj razini je Nacionalni institut za higijenu, a naš laboratorij je izravno podređen gore spomenutoj središnjoj instituciji.
Contacts: izabela.drozdz(at)umed.lodz.pl / maciej.borowiec(at)umed.lodz.pl
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Lisbon – Portugal
INSA – Nacionalni referentni laboratorij za gripu i druge respiratorne viruse
Laboratorijska dijagnostika
- Multipleks PCR (gripa, SARS-CoV-2, respiratorni virus)
- Kultura virusa (gripa, SARS-CoV-2)
- Serologija: Gripa (test inhibicije hemaglutinacije)
- SARS-CoV-2 (IgG anti-Spike, IgG anti-nuklokapsid, IgM; imunokemioluminiscentni test – Abbott)
- WGS Gripa i SARS-CoV-2
- Testovi osjetljivosti na antivirusne lijekove: Fenotipski i genotipski testovi
Laboratorijski objekti
- BSL2 i BSL3
- Odjel za kulturu virusa; Odjel za respiratorne bakterije (TB, Legionela, Neisseria, Pneumoniae, Haemophilus)
Nacionalni program nadzora za gripu i druge respiratorne viruse
Contacts: isabel.carvalho(at)insa.min-saude.pt / raquel.guiomar(at)insa.min-saude.pt / Nuno.Verdasca(at)insa.min-saude.pt
CCL – CASSOVIA COVID LAB
Kosice – Slovakia
CCL – CASSOVIA COVID LAB
- Akreditirani laboratorij za molekularnu dijagnostiku COVID-19
- Sveučilišni laboratorij, BSL-2 laboratorij
- Dio nacionalne mreže za dijagnostiku COVID-19
- Zajedničko radno mjesto 2 odjela
- Odjel za epidemiologiju
- Odjel za medicinsku i kliničku biokemiju
- Ostale dijagnostičke metode: serologija, test neutralizacije seruma – samo u okviru istraživačkih projekata
- Bakteriološki laboratorij nalazi se u Odjelu za medicinsku i kliničku mikrobiologiju
Contacts: monika.halanova(at)upjs.sk / miroslava.rabajdova(at)upjs.sk
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Madrid – Spain
Mikrobiološka služba, bolnica La Paz
Sveučilišna bolnica La Paz je tercijarni centar zdravstvene zaštite u sjevernom Madridu koji godišnje primi preko 58 000 pacijenata i brine se za preko 1 500 000 ambulantnih pacijenata. Odjel za kliničku mikrobiologiju i parazitologiju bolnice funkcionalno je podijeljen u nekoliko jedinica koje uključuju:
- Virusologiju
- Serologiju
- Bakteriologiju
- Mikologiju
- Parazitologiju
- Testiranje osjetljivosti na antibiotike
- Sekvenciranje sljedeće generacije
- Istraživanje i razvoj molekularne mikrobiologije
- BSL-3 laboratorij
Odjel za kliničku mikrobiologiju i parazitologiju koristi klasične i molekularne mikrobiološke tehnike koje uključuju PCR, sekvenciranje cijelog genoma i metagenomiku. Odjel je također dio nacionalne mreže za nadzor respiratornih virusa, uključujući SARS-CoV-2.
Contacts: eliedahdouh(at)gmail.com
Clinical Virology – University Hospital Basel
Basel – Switzerland
Klinička virologija – Sveučilišna bolnica Basel
Misija
Odjel za kliničku virologiju u Sveučilišnoj bolnici Basel nudi sveobuhvatan raspon analiza za dijagnosticiranje virusnih bolesti kod ljudi. Posvećeni unapređenju i validaciji novih tehnologija i specijaliziranih testova, blisko surađujemo s kliničarima i akademskim partnerima kako bismo pružili pouzdana, vrhunska dijagnostička rješenja za zarazne bolesti.
Nacionalni nadzor i referentni centar WHO-a
U našoj predanosti javnom zdravstvu, aktivno se bavimo stručnim aktivnostima, ugošćujući referentne centre WHO-a za polio i enteroviruse te Nacionalni centar za potvrdu dijagnostičkog testiranja HIV-a. Određeni od strane Saveznog ureda za javno zdravstvo Švicarske, pružamo stručnost u području gripe i drugih respiratornih virusa, podržavajući nacionalne napore nadzora i odgovora.
Laboratorijski objekti i dijagnostika
Naši laboratorijski kapaciteti uključuju širok raspon dijagnostičkih metoda, kao što su multipleks PCR testiranje, serologija, kultura virusa, testiranje antivirusne osjetljivosti (fenotipsko i genotipsko), sekvenciranje sljedeće generacije i sekvenciranje Nanopore treće generacije. Kombinirajući najsuvremenije tehnologije s našim stručnim znanjem i snažnom suradnjom s kliničkim timovima i akademskim istraživačima, nastojimo pružiti visokokvalitetne dijagnostičke usluge i doprinijeti nadzoru i istraživanju zaraznih bolesti.
Contacts: karoline.leuzinger(a)usb.ch, rainer.gosert(a)usb.ch