Acceleration og styrkelse af responsen på fremkomsten af nye respiratoriske vira.
Et netværk af virologilaboratorier, der bruger den samme teknik til hurtige, robuste og sammenlignelige resultater.
Med det formål at styrke vores beredskab og reaktionsevne i tilfælde af en ny virusudvikling og inden for rammerne af Discovery-forsøget blev VIRvOLT, som står for Virology Operational Laboratories for Drug Testing, oprettet som en del af det europæiske projekt EU-RESPONSE. VIRvOLT, der står for Virology Operational Laboratories for Drug Testing, er udviklet af CNR (National Reference Centre for Viruses of Respiratory Infections) på Hospices Civils de Lyon (HCL-Frankrig) i samarbejde med bioMérieux. VIRvOLT – som nu er til rådighed for det europæiske projekt PROACT EU-RESPONSE – er et kriseberedskabsværktøj, der supplerer det kliniske netværk med virologilaboratorier på stedet.
VIRvOLTs laboratorier kan hurtigt måle normaliserede virusmængder i respirationsprøver og give sammenlignelige resultater uanset den anvendte molekylære platform. Takket være VIRvOLT og vores kontinuerlige arbejde med at harmonisere teknikker kan vi vurdere den virale effekt af testede behandlinger på et givet tidspunkt for mellemliggende eller endelige resultater.
Elleve europæiske virologilaboratorier har gennemført valideringsprocessen og tilsluttet sig VIRvOLT. De udfører en ekstern kvalitetsvurdering og deltager i en arbejdsgruppe én gang om året. Dette netværk sigter mod at integrere nye partnere og er i øjeblikket i kontakt med laboratorier i Irland, Norge og Italien.
Contacts
Nathalie Bergaud
Project manager
nathalie.bergaud01@chu-lyon.fr
Maude Bouscambert-Duchamp
Virologist
maude.bouscambert-duchamp@chu-lyon.fr
Alexandre Gaymard
Virologist
alexandre.gaymard@chu-lyon.fr
Netværk af europæiske virologilaboratorier
VIRvOLT – Virologiske operationelle laboratorier til lægemiddeltestning
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Brussels – Belgium
LHUB-ULB – Universitetshospitalets laboratorium i Bruxelles
LHUB-ULB’s mikrobiologiske afdeling er ansvarlig for laboratorieanalyser udført i forbindelse med forebyggende, diagnostisk og terapeutisk pleje af patienter, der lider af infektionssygdomme. I denne sammenhæng består vores mission i at levere kvalitetsresultater inden for en optimeret responstid ved at fremme effektivitet, banebrydende teknologier, ekspertise og tværfaglighed samt stærke interaktioner med klinikerne på vores partnerhospitaler.
Mikrobiologiafdelingen består af 6 klinikker og medicinske enheder og udfører sine aktiviteter i hvert af vores 4 aktivitetscentre.
Mikrobiologiafdelingen udfører også ekspertise inden for undersøgelse og overvågning af visse infektioner i Belgien og er vært for 4 nationale referencecentre (Staphylococcus-arter, Campylobacter-arter, Haemophilus influenza og Legionella-arter). Han udfører også forskningsprojekter inden for diagnose, epidemiologi og resistens over for antiinfektiøse midler.
Contacts: Benoit.PREVOST(at)LHUB-ULB.BE
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Brno – Czech Republic
Fakultetshospital, Institut for Klinisk Mikrobiologi og Immunologi
Laboratoriediagnostik
- Molekylær mikrobiologi (Multiplex PCR – herpesvirus, luftvejsinfektioner, meningitis, gastrointestinal infektion, STD, HAV, HBV, HCV, HEV, Borrelia, andet)
- Bakteriologi, parasitologi, mykologi, antibiotikaresistens
- Infektionsimmunologi (antistofdetektion mod forskellige virale og bakterielle agenser)
- Immunopatologi (detektion af antistoffer i autoimmune sygdomme, allergier)
- BSL2 Laboratorienheder
Contacts: Kaevska.Marija(at)fnbrno.cz / ZdrazilovaDubska.Lenka(at)fnbrno.cz / Mrkvicova.Martina(at)fnbrno.cz
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Lyon – France
CNR – Nationalt Referencecenter for vira af infektionssygdomme
Udpeget af Sundhedsministeriet, og mere specifikt af Generaldirektoratet for Sundhed (DGS) og af Santé Publique France (SPF), til at yde ekspertise om influenza og andre luftvejsvirus
En del af Instituttet for Infektionsstoffer (IAI):
- Mikrobiologisk ekspertise, herunder virologisk ekspertise
- Molekylærbiologi, viruskultur, serologi, serumneutralisering
- Adgang til BSL 3-faciliteter
Missioner
National overvågning af epidemiologi af luftvejsvirus baseret på flere netværk, der leverer prøver til analyse af CNR
- Praktisk praktiserende læger
- Hospitalslaboratorier
- Private laboratorier
National overvågning og håndtering i tilfælde af opståen
Virologists: maude.bouscambert-duchamp(at)chu-lyon.fr & alexandre.gaymard(at)chu-lyon.fr
Project Manager : nathalie.bergaud01(at)chu-lyon.fr
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Athens – Greece
Evaggelismos General Hospital, Afdeling for Klinisk Mikrobiologi
Afdelingen for Klinisk Mikrobiologi er et hospitalslaboratorium, der tilhører Grækenlands største generalhospital i Athen (Evaggelismos General Hospital).
Afdelingen er opdelt i underafdelinger:
- Afdeling for Klassisk Bakteriologi (blodkulturer, urinkulturer, respiratoriske prøvekulturer osv., MALDI-TOF-analyse, Mykologi, Parasitologi)
- Afdeling for Serologi (påvisning af IgG, IgM, IgA og Ag med ELISA, IFA, CLIA osv.)
- Afdeling for Antibiotika
- Afdeling for Tuberkulose
- Afdeling for Molekylær Diagnostik (påvisning af respiratoriske vira, herpesvira, polyomavira, parvovirus B19 og protozoer såsom Toxoplasma og Leishmania, med molekylærbiologiske metoder. Molekylære epidemiologiske undersøgelser til påvisning af resistens i nosokomielle patogener)
Afdelingen er et BSL-2-laboratorium og er en del af det nationale netværk for diagnostisk testning af SARS-CoV-2
Contact: ekraniot(at)yahoo.com
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
Pécs – Hungary
Universitetets Kliniske Center, Institut for Laboratoriemedicin – Enhed for Molekylær Genetik
- Klinisk rutinediagnostisk laboratorium (den største udbyder af laboratoriediagnostiske tjenester i den sydlige Transdanubien-region). Der er mere end 250 typer test i vores laboratorium, hvoraf næsten 2,5 millioner udføres årligt. Vores institut er et FJ-3-laboratorium, der er i drift døgnet rundt.
- Enhed for Molekylær Genetik er et BSL-2-laboratorium, der har haft akkrediteret status til 15 molekylærdiagnostiske testprocesser siden 2016 af den nationale akkrediteringsmyndighed.
- Den diagnostiske palet omfatter nukleinsyrebaseret diagnostisk testning af bakterielle og virale humane patogener og automatiseret serologitestning (HPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, Hepatitis B og C-virus, HSV 1/2, CMV, EBV, PB19 og SARS-CoV-2 kvalitativ, kvantitativ og genotypeanalyse, SARS-CoV-2 anti-spike og anti-nukleokapsid IgM/IgG-detektion).
- Universitetet i Pécs har udviklet det bakteriologiske laboratorium (dyrkning, serologi og MALDI-TOF-analyse) i Institut for Mikrobiologi.
- Laboratorieenheden er også akkrediteret til genetisk testning af Faktor II og Faktor V, MTHFR, APOE og multiresistensgenmutationer og polymorfier (MDR).
- Den ungarske nationale sundhedsforsikringsfond (NEAK) udpeger laboratorieenheder til patogentestning, hvis det diagnostiske eller overvågningsbehov for testning overstiger National Center for Epidemiologys centrale laboratoriekapacitet. Universitetet i Pécs er udpeget til SARS-CoV-2-diagnostik og -overvågning i den sydlige Transdanubiske region (3 amter).
Contacts: gombos.katalin(at)pte.hu / urban.peter(at)pte.hu
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
Luxemburg
LNS – Laboratoire national de Santé – Institut for mikrobiologi
- Offentlig institution oprettet ved lov af 7. august 2012 og underlagt tilsyn af Sundhedsministeriet i Luxembourg
- Tværfagligt institut med 4 afdelinger og 2 nationale centre:
- Nationalt Center for Patologi
- Nationalt Center for Genetik
- Medicinsk Biologi
- Mikrobiologi
- Retsmedicin
- Sundhedsbeskyttelse
- Afdeling for Mikrobiologi: 3 tjenester
- Bakteriologi – mykologi – antibiotikaresistens og hospitalshygiejne
- Virologi og Serologi
- Patogensekventering: epidemiologisk og genomisk overvågning af patogener af offentlig interesse
- Afdelingen arbejder tæt sammen med Sundhedsministeriet og ECDC for at støtte overvågning af patogener
- Afdeling for Mikrobiologi er nomineret som nationalt referencelaboratorium for akutte luftvejsinfektioner, HIV og viral hepatitis
- Infrastruktur i afdelingen: BSL-3
Contacts: Trung.Nguyen(at)lns.etat.lu / Megane.Migliorini(at)lns.etat.lu / Sabrina.Deroo(at)lns.etat.lu
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Łódź – Poland
Laboratorium for respiratoriske virus ved det medicinske universitet i Łódź
Laboratoriet for respiratoriske virus ved det medicinske universitet i Łódź er placeret i Łódź, Polen.
Vores laboratorium har faciliteter til at udføre biomolekylære metoder.
Laboratoriet var et af de første referencelaboratorier i Polen, der fik autorisation til en højkompleks, molekylærbaseret SARS CoV-2-laboratorieudviklet test.
Tilsynsorganet på nationalt niveau er det nationale institut for hygiejne, og vores laboratorium er direkte underlagt den ovennævnte centrale institution.
Contacts: izabela.drozdz(at)umed.lodz.pl / maciej.borowiec(at)umed.lodz.pl
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Lisbon – Portugal
INSA – Nationalt referencelaboratorium for influenza og andre respiratoriske vira
Laboratoriediagnose
- Multiplex PCR (influenza, SARS-CoV-2, respiratorisk virus)
- Viruskultur (influenza, SARS-CoV-2)
- Serologi: Influenza (hæmaglutinationshæmningsassay)
- SARS-CoV-2 (IgG anti-Spike, IgG anti-nukleokapsid, IgM; imunokemioluminescerende assay – Abbott)
- WGS Influenza og SARS-CoV-2
- Antivirale følsomhedsanalyser: Fænotypiske og genotypiske analyser
Laboratoriefaciliteter
- BSL2 og BSL3
- Viruskulturenhed; Respiratorisk bakterieenhed (TB, Legionela, Neisseria, Pneumo, Haemophilus)
Nationalt overvågningsprogram for influenza og andre respiratoriske vira
Contacts: isabel.carvalho(at)insa.min-saude.pt / raquel.guiomar(at)insa.min-saude.pt / Nuno.Verdasca(at)insa.min-saude.pt
CCL – CASSOVIA COVID LAB
Kosice – Slovakia
CCL – CASSOVIA COVID-LAB
- Akkrediteret Molekylær Diagnostisk Laboratorium for COVID-19
- Universitetslaboratorium, BSL-2 laboratorium
- En del af det nationale netværk til diagnostik af COVID-19
- Fælles arbejdsplads for 2 institutter
- Afdeling for Epidemiologi
- Afdeling for Medicinsk og Klinisk Biokemi
- Andre diagnostiske metoder: serologi, serumneutraliseringstest – kun inden for forskningsprojekter
- Bakteriologisk Laboratorium er placeret i Afdeling for Medicinsk og Klinisk Mikrobiologi
Contacts: monika.halanova(at)upjs.sk / miroslava.rabajdova(at)upjs.sk
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Madrid – Spain
Mikrobiologitjeneste, La Paz Hospital
La Paz Universitetshospital er et tertiært plejecenter i det nordlige Madrid-område, der modtager over 58.000 indlæggelser og behandler over 1.500.000 ambulante patienter om året. Hospitalets afdeling for klinisk mikrobiologi og parasitologi er funktionelt opdelt i flere enheder, der omfatter:
- Virologi
- Serologi
- Bakteriologi
- Mykologi
- Parasitologi
- Antibiotikafølsomhedstestning
- Næste generations sekventering
- Molekylær mikrobiologisk forskning og udvikling
- BSL-3-laboratorium
Afdelingen for klinisk mikrobiologi og parasitologi anvender både klassiske og molekylære mikrobiologiske teknikker, der omfatter PCR’er, helgenomsekventering og metagenomik. Afdelingen er også en del af det nationale overvågningsnetværk for respiratoriske vira, herunder SARS-CoV-2.
Contacts: eliedahdouh(at)gmail.com
Clinical Virology – University Hospital Basel
Basel – Switzerland
Klinisk virologi – Universitetshospitalet Basel
Mission
Den kliniske virologiske enhed på Universitetshospitalet Basel tilbyder en omfattende række analyser til diagnosticering af virussygdomme hos mennesker. Vi er dedikeret til at udvikle og validere nye teknologier og specialiserede assays og samarbejder tæt med klinikere og akademiske partnere for at levere pålidelige, banebrydende diagnostiske løsninger til infektionssygdomme.
Nationalt overvågnings- og WHO-referencecenter
I vores engagement i folkesundhed engagerer vi os aktivt i ekspertaktiviteter og er vært for WHO’s referencecentre for polio og enterovirus og det nationale bekræftelsescenter for HIV-diagnostisk testning. Udpeget af det føderale kontor for folkesundhed i Schweiz tilbyder vi ekspertise inden for influenza og andre respiratoriske vira og understøtter nationale overvågnings- og responsindsatser.
Laboratoriefaciliteter og diagnostik
Vores laboratoriekapaciteter omfatter en bred vifte af diagnostiske metoder, såsom multiplex PCR-testning, serologi, viruskultur, antiviral følsomhedstestning (fænotypisk og genotypisk), næste generations sekventering og tredje generations nanopore-sekventering. Ved at kombinere den nyeste teknologi med vores ekspertise og stærke samarbejde med kliniske teams og akademiske forskere, stræber vi efter at levere diagnostiske tjenester af høj kvalitet og bidrage til overvågning og forskning i infektionssygdomme.
Contacts: karoline.leuzinger(a)usb.ch, rainer.gosert(a)usb.ch