Urychlení a posílení reakce na nově vznikající respirační viry.
Síť virologických laboratoří využívajících stejnou techniku pro rychlé, robustní a srovnatelné výsledky.
Pro posílení naší připravenosti a schopnosti reagovat na nově vznikající viry byla v rámci studie Discovery a evropského projektu EU-RESPONSE vytvořena síť VIRvOLT (Virology Operational Laboratories for Drug Testing).
Síť VIRvOLT, vyvinutá francouzským Národním referenčním centrem (CNR) pro respirační virové infekce v Hospices Civils de Lyon (HCL, Francie) ve spolupráci se společností bioMérieux, je strategickým nástrojem pro přípravu na zdravotní krize.
Nyní integrovaná do evropského projektu PROACT EU-RESPONSE posiluje stávající klinickou síť přidáním místních provozních virologických laboratoří.
Laboratoře VIRvOLT umožňují rychlé měření standardizované virové zátěže ve vzorcích dýchacích cest a poskytují srovnatelné výsledky bez ohledu na použitou molekulární platformu. Díky VIRvOLT a našemu neustálému úsilí o harmonizaci technik můžeme kdykoli posoudit virovou účinnost testovaných léčebných postupů, a to jak pro průběžné, tak i konečné výsledky.
Jedenáct evropských virologických laboratoří úspěšně dokončilo validační proces a připojilo se k VIRvOLT. Provádějí externí hodnocení kvality a jednou ročně se účastní pracovní skupiny. Tato síť si klade za cíl integrovat nové partnery a v současné době je v kontaktu s laboratořemi v Irsku, Norsku a Itálii.
Contacts
Nathalie Bergaud
Project manager
nathalie.bergaud01@chu-lyon.fr
Maude Bouscambert-Duchamp
Virologist
maude.bouscambert-duchamp@chu-lyon.fr
Alexandre Gaymard
Virologist
alexandre.gaymard@chu-lyon.fr
Evropská síť virologických laboratoří
VIRvOLT – Síť provozních virologických laboratoří pro hodnocení léčby
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Brussels – Belgium
LHUB-ULB – Univerzitní nemocniční laboratoř v Bruselu
Mikrobiologické oddělení LHUB-ULB je zodpovědné za laboratorní analýzy prováděné během preventivní, diagnostické a terapeutické péče o pacienty trpící infekčními onemocněními. V této souvislosti spočívá naše poslání v poskytování kvalitních výsledků v optimalizované době odezvy, a to prosazováním efektivity, špičkových technologií, odborných znalostí a multidisciplinárnosti a silné interakce s klinickými lékaři našich partnerských nemocnic.
Mikrobiologické oddělení se skládá ze 6 klinik a lékařských jednotek a své aktivity realizuje v každém ze 4 center aktivit.
Mikrobiologické oddělení se také zabývá odbornou činností ve studiu a sledování některých infekcí v Belgii a hostí 4 národní referenční centra (druhy Staphylococcus, druhy Campylobacter, Haemophilus influenza a druhy Legionella). Vede také výzkumné projekty v oblasti diagnostiky, epidemiologie a rezistence na antiinfekční látky.
Contacts: Benoit.PREVOST(at)LHUB-ULB.BE
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Brno – Czech Republic
Katedra klinické mikrobiologie a imunologie Fakultní nemocnice
Laboratorní diagnostika
- Molekulární mikrobiologie (Multiplexní PCR – herpesviry, respirační, meningitida, gastrointestinální, pohlavně přenosné choroby, HAV, HBV, HCV, HEV, boreliózy, další)
- Bakteriologie, parazitologie, mykologie, antibiotická rezistence
- Infekční imunologie (detekce protilátek proti různým virovým a bakteriálním agens)
- Imunopatologie (detekce protilátek u autoimunitních onemocnění, alergií)
- BSL2 Laboratorní jednotky
Contacts: Kaevska.Marija(at)fnbrno.cz / ZdrazilovaDubska.Lenka(at)fnbrno.cz / Mrkvicova.Martina(at)fnbrno.cz
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Lyon – France
CNR – Národní referenční centrum pro viry infekčních onemocnění
Určeno ministerstvem zdravotnictví, a zejména Generálním ředitelstvím zdravotnictví (DGS) a Santé Publique France (SPF), k poskytování odborných znalostí o chřipce a dalších respiračních virech.
Součást Institutu pro infekční agens (IAI):
- Mikrobiologické odborné znalosti, včetně virologických.
- Molekulární biologie, virové kultivace, sérologie, neutralizace séra.
- Přístup k zařízením BSL 3
Mise
Celostátní dohled nad epidemiologií respiračních virů založený na několika sítích poskytujících vzorky k analýze CNR
- Praktičtí lékaři
- Nemocniční laboratoře
- Soukromé laboratoře
Celostátní dohled a řízení v případě nouze
Virologists: maude.bouscambert-duchamp(at)chu-lyon.fr & alexandre.gaymard(at)chu-lyon.fr
Project Manager : nathalie.bergaud01(at)chu-lyon.fr
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Athens – Greece
Oddělení klinické mikrobiologie všeobecné nemocnice Evaggelismos
Oddělení klinické mikrobiologie je nemocniční laboratoří patřící k největší řecké všeobecné nemocnici v Aténách (Všeobecná nemocnice Evaggelismos).
Oddělení je rozděleno na suboddělení:
- Oddělení klasické bakteriologie (krevní kultury, kultury moči, kultury respiračních vzorků atd., analýza MALDI-TOF, mykologie, parazitologie)
- Oddělení sérologie (detekce IgG, IgM, IgA a Ag pomocí ELISA, IFA, CLIA atd.)
- Oddělení antibiogramů
- Oddělení tuberkulózy
- Oddělení molekulární diagnostiky (detekce respiračních virů, herpes virů, polyomavirů, parvoviru B19 a prvoků, jako je Toxoplasma a Leishmania, metodami molekulární biologie. Molekulárně epidemiologické studie pro detekci rezistence u nozokomiálních patogenů)
Oddělení je laboratoří BSL-2 a je součástí národní sítě pro diagnostické testování SARS-CoV-2.
Contact: ekraniot(at)yahoo.com
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
Pécs – Hungary
Klinické centrum Univerzity v Pécsu Oddělení laboratorní medicíny – Jednotka molekulární genetiky
- Klinická rutinní diagnostická laboratoř (největší poskytovatel laboratorních diagnostických služeb v regionu Jižní Zadunají). V naší laboratoři provádíme více než 250 typů testů, z nichž se ročně provede téměř 2,5 milionu. Náš ústav je laboratoří FJ-3, která pracuje nepřetržitě 24 hodin denně.
- Oddělení molekulární genetiky je laboratoř BSL-2, která je od roku 2016 akreditována Národním akreditačním úřadem pro 15 molekulárně diagnostických testovacích postupů.
- Diagnostická paleta zahrnuje diagnostické testování bakteriálních a virových lidských patogenů na bázi nukleových kyselin a automatizované sérologické testování (kvalitativní, kvantitativní a genotypová analýza HPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, viru hepatitidy B a C, HSV 1/2, CMV, EBV, PB19 a SARS-CoV-2, detekce anti-spike a anti-nukleokapsidových IgM/IgG proti SARS-CoV-2).
- University of Pecs developed the bacteriology laboratory (culturing, serology and MALDI-TOF analysis) in the Department of Microbiology.
- Univerzita v Pécsu vyvinula bakteriologickou laboratoř (kultivace, sérologie a MALDI-TOF analýza) na katedře mikrobiologie. Laboratorní jednotka je také akreditována pro genetické testování faktoru II a faktoru V, MTHFR, APOE a genových mutací a polymorfismů multilékové rezistence (MDR).
- Maďarský národní fond zdravotního pojištění (NEAK) jmenuje laboratorní jednotky pro testování patogenů, pokud diagnostická nebo sledovací potřeba testování překračuje kapacitu centrální laboratoře Národního centra pro epidemiologii. Univerzita v Péci je pověřena diagnostikou a sledováním SARS-CoV-2 v regionu Jižní Zadunaj (3 okresy).
Contacts: gombos.katalin(at)pte.hu / urban.peter(at)pte.hu
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
Luxemburg
LNS – Národní zdravotní laboratoř – Katedra mikrobiologie
- Veřejná instituce zřízená zákonem ze dne 7. srpna 2012 a působící pod dohledem Ministerstva zdravotnictví v Lucembursku
- Multidisciplinární ústav se 4 odděleními a 2 národními centry:
- Národní centrum patologie
- Národní centrum genetiky
- Lékařská biologie
- Mikrobiologie
- Soudní lékařství
- Ochrana zdraví
- Oddělení mikrobiologie: 3 služby
- Bakteriologie – mykologie – rezistence na antibiotika a nemocniční hygiena
- Virologie a sérologie
- Sekvenování patogenů: epidemiologické a genomické monitorování patogenů veřejného zájmu
- Oddělení úzce spolupracuje s Ministerstvem zdravotnictví a ECDC na podpoře sledování patogenů
- Oddělení mikrobiologie je nominováno jako Národní referenční laboratoř pro akutní respirační infekce, HIV a virovou hepatitidu
- Infrastruktura v oddělení: BSL-3
Contacts: Trung.Nguyen(at)lns.etat.lu / Megane.Migliorini(at)lns.etat.lu / Sabrina.Deroo(at)lns.etat.lu
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Łódź – Poland
Laboratoř respiračních virů Lékařské univerzity v Lodži
Laboratoř respiračních virů Lékařské univerzity v Lodži se nachází v Lodži v Polsku.
Naše laboratoř má vybavení k provádění biomolekulárních metodologií.
Laboratoř byla jednou z prvních referenčních laboratoří v Polsku, která získala autorizaci pro vysoce komplexní molekulárně založený test SARS CoV-2 vyvinutý laboratoří.
Dozorčím orgánem na národní úrovni je Národní hygienický ústav a naše laboratoř je přímo podřízena výše uvedené ústřední instituci.
Contacts: izabela.drozdz(at)umed.lodz.pl / maciej.borowiec(at)umed.lodz.pl
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Lisbon – Portugal
INSA – Národní referenční laboratoř pro chřipku a další respirační viry
Laboratorní diagnostika
- Multiplexní PCR (chřipka, SARS-CoV-2, respirační virus)
- Kultura viru (chřipka, SARS-CoV-2)
- Serologie: Chřipka (test inhibice hemaglutinace)
- SARS-CoV-2 (IgG anti-Spike, IgG anti-nuklokapsid, IgM; imunochemioluminiscenční test – Abbott)
- WGS Chřipka a SARS-CoV-2
- Testy citlivosti na antivirové přípravky: Fenotypové a genotypové testy
Laboratorní zařízení
- BSL2 a BSL3
- Jednotka pro kultivaci virů; Jednotka pro respirační bakterie (TB, Legionela, Neisseria, Pneumoniae, Haemophilus)
Národní program sledování chřipky a dalších respiračních virů
Contacts: isabel.carvalho(at)insa.min-saude.pt / raquel.guiomar(at)insa.min-saude.pt / Nuno.Verdasca(at)insa.min-saude.pt
CCL – CASSOVIA COVID LAB
Kosice – Slovakia
CCL – CASSOVIA COVID LAB
- Akreditovaná laboratoř molekulární diagnostiky COVID-19
- Univerzitní laboratoř, laboratoř BSL-2
- Součást národní sítě pro diagnostiku COVID-19
- Společné pracoviště 2 kateder
- Katedra epidemiologie
- Katedra lékařské a klinické biochemie
- Další diagnostické metody: sérologie, sérový neutralizační test – pouze v rámci výzkumných projektů
- Bakteriologická laboratoř se nachází v katedře lékařské a klinické mikrobiologie
Contacts: monika.halanova(at)upjs.sk / miroslava.rabajdova(at)upjs.sk
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Madrid – Spain
Mikrobiologická služba, nemocnice La Paz
Univerzitní nemocnice La Paz je terciární centrum péče v severní části Madridu, které ročně přijme přes 58 000 pacientů a pečuje o více než 1 500 000 ambulantních pacientů. Oddělení klinické mikrobiologie a parazitologie nemocnice je funkčně rozděleno do několika jednotek, které zahrnují:
- Virologii
- Sérologii
- Bakteriologii
- Mykologii
- Parazitologii
- Testování citlivosti na antibiotika
- Sekvenování nové generace
- Výzkum a vývoj v oblasti molekulární mikrobiologie
- Laboratoř BSL-3
Oddělení klinické mikrobiologie a parazitologie využívá klasické i molekulárně mikrobiologické techniky, které zahrnují PCR, sekvenování celého genomu a metagenomiku. Oddělení je také součástí národní sítě pro sledování respiračních virů, včetně SARS-CoV-2.
Contacts: eliedahdouh(at)gmail.com
Clinical Virology – University Hospital Basel
Basel – Switzerland
Klinická virologie – Univerzitní nemocnice v Basileji
Poslání
Klinická virologická jednotka Univerzitní nemocnice v Basileji nabízí komplexní škálu analýz pro diagnostiku virových onemocnění u lidí. Věnujeme se rozvoji a validaci nových technologií a specializovaných testů a úzce spolupracujeme s klinickými lékaři a akademickými partnery na poskytování spolehlivých a špičkových diagnostických řešení pro infekční onemocnění.
Národní centrum pro sledování a referenční centrum WHO
V rámci našeho závazku k veřejnému zdraví se aktivně zapojujeme do odborných činností a hostíme referenční centra WHO pro polioviry a enteroviry a Národní konfirmační centrum pro diagnostické testování HIV. Jsme určeni Federálním úřadem pro veřejné zdraví Švýcarska a poskytujeme odborné znalosti v oblasti chřipky a dalších respiračních virů a podporujeme národní úsilí v oblasti sledování a reakce.
Laboratorní vybavení a diagnostika
Naše laboratorní kapacity zahrnují širokou škálu diagnostických metod, jako je multiplexní PCR testování, sérologie, virové kultivace, testování antivirové citlivosti (fenotypové a genotypové), sekvenování nové generace a sekvenování Nanopore třetí generace. Kombinací nejmodernějších technologií s našimi odbornými znalostmi a silnou spoluprací s klinickými týmy a akademickými výzkumníky se snažíme poskytovat vysoce kvalitní diagnostické služby a přispívat k sledování a výzkumu infekčních onemocnění.
Contacts: karoline.leuzinger(a)usb.ch, rainer.gosert(a)usb.ch
