Versnelling en versterking van de respons op de opkomst van nieuwe respiratoire virussen.
Een netwerk van virologische laboratoria die dezelfde techniek gebruiken voor snelle, robuuste en vergelijkbare resultaten.
Om onze paraatheid en reactievermogen te versterken in geval van een nieuwe virale opduiking en in het kader van de Discovery-studie, is binnen het Europese project EU-RESPONSE VIRvOLT opgericht, wat staat voor Virology Operational Laboratories for Drug Testing. VIRvOLT, ontwikkeld door het CNR (Nationaal Referentiecentrum voor virussen van respiratoire infecties) van de Hospices Civils de Lyon (HCL-Frankrijk), in samenwerking met bioMérieux, is nu beschikbaar via het Europese project PROACT EU-RESPONSE, een hulpmiddel voor crisisparaatheid dat het klinische netwerk aanvult met virologische laboratoria ter plaatse.
De laboratoria van VIRvOLT kunnen snel genormaliseerde virale ladingen in respiratoire monsters meten en vergelijkbare resultaten leveren, ongeacht het gebruikte moleculaire platform. Dankzij VIRvOLT en onze voortdurende inspanningen om technieken te harmoniseren, kunnen we de virale werkzaamheid van geteste behandelingen op elk gewenst moment beoordelen op intermediaire of definitieve uitkomsten.
Elf Europese virologielaboratoria hebben het validatieproces succesvol afgerond en zich aangesloten bij VIRvOLT. Ze voeren jaarlijks een externe kwaliteitsbeoordeling uit en nemen deel aan een werkgroep. Dit netwerk streeft ernaar nieuwe partners te integreren en staat momenteel in contact met laboratoria in Ierland, Noorwegen en Italië.
Contacts
Nathalie Bergaud
Project manager
nathalie.bergaud01@chu-lyon.fr
Maude Bouscambert-Duchamp
Virologist
maude.bouscambert-duchamp@chu-lyon.fr
Alexandre Gaymard
Virologist
alexandre.gaymard@chu-lyon.fr
Netwerk van Europese virologielaboratoria
VIRvOLT – Operationele virologische laboratoria voor drugstesten
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Brussels – Belgium
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
De afdeling microbiologie van het LHUB-ULB is verantwoordelijk voor de laboratoriumanalyses die worden uitgevoerd in het kader van de preventieve, diagnostische en therapeutische zorg voor patiënten met infectieziekten. In deze context bestaat onze missie uit het leveren van kwaliteitsresultaten binnen een geoptimaliseerde responstijd door efficiëntie, geavanceerde technologieën, expertise en multidisciplinariteit te bevorderen, en door nauwe interactie met de clinici van onze partnerziekenhuizen.
De afdeling microbiologie bestaat uit 6 klinieken en medische eenheden en is actief in elk van onze 4 activiteitencentra.
De afdeling microbiologie verricht ook expertise in de studie en surveillance van bepaalde infecties in België en huisvest 4 nationale referentiecentra (Staphylococcus-soorten, Campylobacter-soorten, Haemophilus influenza en Legionella-soorten). De afdeling voert ook onderzoeksprojecten uit op het gebied van diagnose, epidemiologie en resistentie tegen anti-infectiva.
Contacts: Benoit.PREVOST(at)LHUB-ULB.BE
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Brno – Czech Republic
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Laboratoriumdiagnose
- Moleculaire microbiologie (multiplex PCR – herpesvirussen, luchtwegen, meningitis, gastro-intestinaal, SOA, HAV, HBV, HCV, HEV, Borrelia, overige)
- Bacteriologie, parasitologie, mycologie, antibioticaresistentie
- Infectieuze immunologie (detectie van antilichamen tegen diverse virale en bacteriële agentia)
- Immunopathologie (detectie van antilichamen bij auto-immuunziekten en allergieën)
- BSL2 Laboratoriumunits
Contacts: Kaevska.Marija(at)fnbrno.cz / ZdrazilovaDubska.Lenka(at)fnbrno.cz / Mrkvicova.Martina(at)fnbrno.cz
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Lyon – France
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Aangewezen door het Ministerie van Volksgezondheid, en meer in het bijzonder door het Directoraat-generaal Volksgezondheid (DGS) en door Santé Publique France (SPF), om expertise te leveren op het gebied van influenza en andere respiratoire virussen.
Onderdeel van het Instituut voor Infectieuze Agentia (IAI):
- Microbiologische expertise, waaronder virologische expertise
- Moleculaire biologie, viruskweek, serologie, serumneutralisatie
- Toegang tot BSL 3-faciliteiten
Opdrachten
Nationale surveillance van de epidemiologie van respiratoire virussen op basis van verschillende netwerken die monsters leveren voor analyse door het CNR
- Huisartsen
- Ziekenhuislaboratoria
- Privélaboratoria
Nationale surveillance en beheersing in geval van nood
Virologists: maude.bouscambert-duchamp(at)chu-lyon.fr & alexandre.gaymard(at)chu-lyon.fr
Project Manager : nathalie.bergaud01(at)chu-lyon.fr
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Athens – Greece
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
De afdeling Klinische Microbiologie is een ziekenhuislaboratorium dat deel uitmaakt van het grootste algemene ziekenhuis van Griekenland in Athene (het Algemeen Ziekenhuis van Evaggelismos).
De afdeling is onderverdeeld in subafdelingen:
- Afdeling Klassieke Bacteriologie (bloedkweken, urinekweken, kweken van respiratoire monsters, enz., MALDI-TOF-analyse, Mycologie, Parasitologie)
- Afdeling Serologie (detectie van IgG, IgM, IgA en Ag met ELISA, IFA, CLIA, enz.)
- Afdeling Antibiogrammen
- Afdeling Tuberculose
- Afdeling Moleculaire Diagnostiek (detectie van respiratoire virussen, herpesvirussen, polyomavirussen, parvovirus B19 en protozoa zoals Toxoplasma en Leishmania, met moleculair-biologische methoden. Moleculaire epidemiologische studies voor de detectie van resistentie bij nosocomiale pathogenen)
De afdeling is een BSL-2 laboratorium en maakt deel uit van het nationale netwerk voor diagnostische testen op SARS-CoV-2.
Contact: ekraniot(at)yahoo.com
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
Pécs – Hungary
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
- Klinisch routinediagnostisch laboratorium (de grootste aanbieder van laboratoriumdiagnostische diensten in de regio Zuid-Transdanubië). Ons laboratorium biedt meer dan 250 soorten tests aan, waarvan er jaarlijks bijna 2,5 miljoen worden uitgevoerd. Ons instituut is een FJ-3 laboratorium, dat 24 uur per dag non-stop operationeel is.
- De afdeling Moleculaire Genetica is een BSL-2 laboratorium en is sinds 2016 door de National Accreditation Authority geaccrediteerd voor 15 moleculaire diagnostische testworkflows.
- Het diagnostisch palet omvat nucleïnezuurgebaseerde diagnostische testen van bacteriële en virale humane pathogenen en geautomatiseerde serologische testen (HPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, hepatitis B- en C-virus, HSV 1/2, CMV, EBV, PB19 en SARS-CoV-2 kwalitatieve, kwantitatieve en genotype-analyse, SARS-CoV-2 anti-spike en anti-nucleocapside IgM/IgG-detectie).
- De Universiteit van Pécs heeft het bacteriologisch laboratorium (kweek, serologie en MALDI-TOF-analyse) binnen de afdeling Microbiologie ontwikkeld.
- De laboratoriumeenheid is ook geaccrediteerd voor genetische testen op factor II en factor V, MTHFR, APOE en multidrug-resistentiegenmutaties en -polymorfismen (MDR).
- Het Hongaarse Nationale Fonds voor Ziektekostenverzekering (NEAK) stelt laboratoriumeenheden aan voor het testen op pathogenen, indien de diagnostische of surveillancebehoefte de centrale laboratoriumcapaciteit van het Nationaal Centrum voor Epidemiologie overschrijdt. De Universiteit van Pécs is aangesteld voor de diagnostiek en surveillance van SARS-CoV-2 in de regio Zuid-Transdanubië (drie provincies).
Contacts: gombos.katalin(at)pte.hu / urban.peter(at)pte.hu
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
Luxemburg
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
- Openbare instelling opgericht bij wet van 7 augustus 2012 en opererend onder toezicht van het Ministerie van Volksgezondheid in Luxemburg
- Multidisciplinair instituut met 4 afdelingen en 2 nationale centra:
- Nationaal Centrum voor Pathologie
- Nationaal Centrum voor Genetica
- Medische Biologie
- Microbiologie
- Forensische geneeskunde
- Gezondheidsbescherming
- Afdeling Microbiologie: 3 diensten
- Bacteriologie – mycologie – antibioticaresistentie en ziekenhuishygiëne
- Virologie en serologie
- Pathogenensequencing: epidemiologische en genomische monitoring van pathogenen van openbaar belang
- De afdeling werkt nauw samen met het Ministerie van Volksgezondheid (MoH) en het ECDC ter ondersteuning van de surveillance van pathogenen
- De afdeling Microbiologie is aangewezen als Nationaal Referentielaboratorium voor Acute Luchtweginfecties, HIV en virale hepatitis
- Infrastructuur van de afdeling: BSL-3
Contacts: Trung.Nguyen(at)lns.etat.lu / Megane.Migliorini(at)lns.etat.lu / Sabrina.Deroo(at)lns.etat.lu
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Łódź – Poland
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Het Respiratoire Viruslaboratorium van de Medische Universiteit van Łódź is gevestigd in Łódź, Polen.
Ons laboratorium beschikt over de faciliteit om biomoleculaire methoden uit te voeren.
Het laboratorium was een van de eerste referentielaboratoria in Polen dat een vergunning kreeg voor een op hoge complexiteit gebaseerde SARS-CoV-2-laboratoriumtest.
De toezichthoudende instantie op nationaal niveau is het Nationaal Instituut voor Hygiëne, en ons laboratorium is direct ondergeschikt aan de bovengenoemde centrale instelling.
Contacts: izabela.drozdz(at)umed.lodz.pl / maciej.borowiec(at)umed.lodz.pl
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Lisbon – Portugal
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Laboratoriumdiagnose
- Multiplex PCR (Influenza, SARS-CoV-2, respiratoir virus)
- Viruskweek (Influenza, SARS-CoV-2)
- Serologie: Influenza (hemagglutinatie-inhibitietest)
- SARS-CoV-2 (IgG anti-Spike, IgG anti-nuclocapside, IgM; immunochemioluminescentietest – Abbott)
- WGS Influenza en SARS-CoV-2
- Antivirale gevoeligheidstesten: Fenotypische en genotypische testen
Laboratoriumfaciliteiten
- BSL2 en BSL3
- Viruskweekeenheid; Respiratoire Bacteriëneenheid (TB, Legionella, Neisseria, Pneumo, Haemophilus)
Nationaal Surveillanceprogramma voor Influenza en andere Resp. Virussen
Contacts: isabel.carvalho(at)insa.min-saude.pt / raquel.guiomar(at)insa.min-saude.pt / Nuno.Verdasca(at)insa.min-saude.pt
CCL – CASSOVIA COVID LAB
Kosice – Slovakia
CCL – CASSOVIA COVID LAB
- Geaccrediteerd Laboratorium voor Moleculaire Diagnostiek COVID-19
- Universitair Laboratorium, BSL-2 laboratorium
- Onderdeel van het landelijke netwerk voor diagnostiek van COVID-19
- Gemeenschappelijke werkplek van 2 afdelingen
- Afdeling Epidemiologie
- Afdeling Medische en Klinische Biochemie
- Overige diagnostische methoden: serologie, serumneutralisatietest – uitsluitend binnen onderzoeksprojecten
- Het Laboratorium voor Bacteriologie is gevestigd bij de afdeling Medische en Klinische Microbiologie
Contacts: monika.halanova(at)upjs.sk / miroslava.rabajdova(at)upjs.sk
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Madrid – Spain
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Het Universitair Ziekenhuis van La Paz is een tertiair zorgcentrum in de regio Noord-Madrid dat jaarlijks meer dan 58.000 patiënten ontvangt en meer dan 1.500.000 poliklinische patiënten behandelt. De afdeling Klinische Microbiologie en Parasitologie van het ziekenhuis is functioneel onderverdeeld in verschillende units, waaronder:
- Virologie
- Serologie
- Bacteriologie
- Mycologie
- Parasitologie
- Antibioticagevoeligheidstesten
- Next-Generation Sequencing
- Moleculaire Microbiologie Onderzoek en Ontwikkeling
- BSL-3 lab
De afdeling Klinische Microbiologie en Parasitologie maakt gebruik van zowel klassieke als moleculaire microbiologische technieken, waaronder PCR, whole-genome sequencing en metagenomics. De afdeling maakt ook deel uit van het nationale surveillancenetwerk voor respiratoire virussen, waaronder SARS-CoV-2.
Contacts: eliedahdouh(at)gmail.com
Clinical Virology – University Hospital Basel
Basel – Switzerland
Clinical Virology – University Hospital Basel
Missie
De afdeling Klinische Virologie van het Universitair Ziekenhuis Basel biedt een uitgebreid scala aan analyses voor de diagnose van virale ziekten bij mensen. Toegewijd aan het ontwikkelen en valideren van nieuwe technologieën en gespecialiseerde assays, werken we nauw samen met clinici en academische partners om betrouwbare, geavanceerde diagnostische oplossingen voor infectieziekten te leveren.
Nationaal Surveillance- en WHO-referentiecentrum
In onze toewijding aan de volksgezondheid nemen we actief deel aan expertiseactiviteiten en huisvesten we de WHO-referentiecentra voor polio- en enterovirussen en het Nationaal Bevestigingscentrum voor hiv-diagnostische tests. Aangewezen door het Zwitserse Federaal Bureau voor Volksgezondheid, bieden we expertise op het gebied van influenza en andere luchtwegvirussen en ondersteunen we de nationale surveillance- en responsinspanningen.
Laboratoriumfaciliteiten en diagnostiek
Onze laboratoriumcapaciteiten omvatten een breed scala aan diagnostische methoden, zoals multiplex PCR-testen, serologie, viruskweek, antivirale gevoeligheidstesten (fenotypisch en genotypisch), next-generation sequencing en third-generation nanopore sequencing. Door de combinatie van de modernste technologieën met onze expertise en nauwe samenwerking met klinische teams en academische onderzoekers, streven wij ernaar om hoogwaardige diagnostische diensten te leveren en een bijdrage te leveren aan de bewaking en het onderzoek naar infectieziekten.
Contacts: karoline.leuzinger(a)usb.ch, rainer.gosert(a)usb.ch