Accélérer et renforcer la réponse à l’émergence de nouveaux virus respiratoires.
Un réseau de laboratoires de virologie utilisant la même technique pour des résultats rapides, robustes et comparables.
Afin de renforcer notre préparation et notre réactivité face à l’émergence de nouveaux virus, VIRvOLT (Virology Operational Laboratories for Drug Testing) a été créé dans le cadre de l’essai Discovery et du projet européen EU-RESPONSE.
Développé par le Centre National de Référence (CNR) des virus des infections respiratoires des Hospices Civils de Lyon (HCL, France), en partenariat avec bioMérieux, VIRvOLT constitue un outil stratégique de préparation aux crises sanitaires.
Désormais intégré au projet européen PROACT EU-RESPONSE, il renforce le réseau clinique existant en y associant des laboratoires de virologie opérationnels sur site.
Les laboratoires de VIRvOLT permettent de mesurer rapidement des charges virales normalisées dans des échantillons respiratoires et de fournir des résultats comparables, quelle que soit la plateforme moléculaire utilisée. Grâce à VIRvOLT et à nos efforts continus d’harmonisation des techniques, nous pouvons évaluer l’efficacité virale des traitements testés à tout moment, pour les résultats intermédiaires ou finaux.
Onze laboratoires de virologie européens ont terminé avec succès le processus de validation et ont rejoint VIRvOLT. Ils effectuent une Evaluation Externe de la Qualité et participent à un groupe de travail une fois par an. Ce réseau vise à intégrer de nouveaux partenaires et est actuellement en contact avec des laboratoires en Irlande, en Norvège et en Italie.
Contacts
Nathalie Bergaud
Project manager
nathalie.bergaud01@chu-lyon.fr
Maude Bouscambert-Duchamp
Virologist
maude.bouscambert-duchamp@chu-lyon.fr
Alexandre Gaymard
Virologist
alexandre.gaymard@chu-lyon.fr
Réseau de laboratoires de virologie européens
VIRvOLT – Réseau de laboratoires de virologie opérationnels pour l’évaluation de traitements
Newsletter
évènements
Groupes de travail
- 2023 – VIRvOLT working group in Oslo
- 2024 – VIRvOLT working group in Madrid
- 2025 – VIRvOLT working group in Verona
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Brussels – Belgium
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Le département de microbiologie du LHUB-ULB est responsable des analyses de laboratoire réalisées lors des soins préventifs, diagnostiques et thérapeutiques des patients atteints de maladies infectieuses. Dans ce contexte, notre mission consiste à fournir des résultats de qualité dans un délai de réponse optimisé en favorisant l’efficacité, les technologies de pointe, l’expertise et la multidisciplinarité, ainsi que de fortes interactions avec les cliniciens de nos hôpitaux partenaires.
Le département de microbiologie est composé de 6 cliniques et unités médicales et déploie ses activités dans chacun de nos 4 centres d’activités.
Le département de microbiologie mène également des activités d’expertise dans l’étude et la surveillance de certaines infections en Belgique et héberge 4 centres nationaux de référence (Staphylococcus, Campylobacter, Haemophilus influenza et Legionella). Il mène également des projets de recherche dans les domaines du diagnostic, de l’épidémiologie et de la résistance aux anti-infectieux.
Contacts: Benoit.PREVOST(at)LHUB-ULB.BE
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Brno – Czech Republic
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Laboratoire de diagnostic
- Microbiologie moléculaire (PCR multiplex – virus de l’herpès, virus respiratoires, méningites, gastro-intestinaux, IST, VHA, VHB, VHC, VHE, Borrelia, autres)
- Bactériologie, Parasitologie, Mycologie, Antibiorésistance
- Immunologie infectieuse (détection d’anticorps contre divers agents viraux et bactériens)
- Immunopathologie (détection d’anticorps dans les maladies auto-immunes, allergies)
- Unités de laboratoire de niveau BSL2
Contacts: Kaevska.Marija(at)fnbrno.cz / ZdrazilovaDubska.Lenka(at)fnbrno.cz / Mrkvicova.Martina(at)fnbrno.cz
CNR – Centre National de Référence des virus des maladies infectieuses
Lyon – France
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Désigné par le ministère chargé de la Santé, plus particulièrement par la Direction générale de la santé (DGS) et par Santé publique France (SPF), pour fournir une expertise sur la grippe et les autres virus respiratoires.
Fonctions au sein de l’Institut des agents infectieux (IAI) :
- Expertise microbiologique et virologique
- Biologie moléculaire, culture virale, sérologie, séroneutralisation
- Accès aux installations de niveau de sécurité biologique 3
Missions
Surveillance nationale de l’épidémiologie des virus respiratoires, s’appuyant sur plusieurs réseaux fournissant des échantillons à analyser par le CNR
- Médecins généralistes
- Laboratoires hospitaliers
- Laboratoires privés
Surveillance nationale et gestion des émergences
Virologists: maude.bouscambert-duchamp(at)chu-lyon.fr & alexandre.gaymard(at)chu-lyon.fr
Project Manager : nathalie.bergaud01(at)chu-lyon.fr
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Athens – Greece
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Le Département de Microbiologie Clinique est un laboratoire hospitalier appartenant au plus grand hôpital général de Grèce, situé à Athènes (Hôpital Général Evaggelismos).
Le Département est divisé en sous-départements :
- Département de Bactériologie Classique (hémocultures, urocultures, cultures d’échantillons respiratoires, etc., analyse MALDI-TOF, mycologie, parasitologie)
- Département de Sérologie (détection des IgG, IgM, IgA et Ag par ELISA, IFA, CLIA, etc.)
- Département d’Antibiogrammes
- Département de Tuberculose
- Département de Diagnostic Moléculaire (détection des virus respiratoires, des virus de l’herpès, des polyomavirus, du parvovirus B19 et des protozoaires tels que Toxoplasma et Leishmania, par des méthodes de biologie moléculaire. Études d’épidémiologie moléculaire pour la détection de la résistance des agents pathogènes nosocomiaux)
Le Département est un laboratoire de niveau de sécurité biologique 2 et fait partie du réseau national de diagnostic du SARS-CoV-2.
Contact: ekraniot(at)yahoo.com
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
Pécs – Hungary
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
- Laboratoire de diagnostic clinique de routine (le plus grand prestataire de services de diagnostic de laboratoire de la région de Transdanubie du Sud). Notre laboratoire propose plus de 250 types de tests, dont près de 2,5 millions sont réalisés chaque année. Notre institut est un laboratoire de niveau FJ-3, fonctionnant 24h/24 et 7j/7.
- L’unité de génétique moléculaire est un laboratoire de niveau BSL-2, accrédité par l’Autorité nationale d’accréditation pour 15 procédures de diagnostic moléculaire depuis 2016.
- La palette diagnostique comprend des tests diagnostiques basés sur les acides nucléiques pour les agents pathogènes humains bactériens et viraux, ainsi que des tests sérologiques automatisés (HPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, virus de l’hépatite B et C, HSV 1/2, CMV, EBV, PB19 et SARS-CoV-2, analyses qualitatives, quantitatives et génotypiques, détection des IgM/IgG anti-spike et anti-nucléocapside du SARS-CoV-2).
- L’Université de Pécs a développé le laboratoire de bactériologie (culture, sérologie et analyse MALDI-TOF) au sein du Département de Microbiologie.
- Ce laboratoire est également accrédité pour les tests génétiques des facteurs II et V, de la MTHFR, de l’APOE et des mutations et polymorphismes des gènes de multirésistance aux antibiotiques (MDR).
- La Caisse nationale d’assurance maladie hongroise (NEAK) désigne des unités de laboratoire pour les analyses d’agents pathogènes, si les besoins de diagnostic ou de surveillance dépassent les capacités du laboratoire central du Centre national d’épidémiologie. L’Université de Pécs est désignée pour le diagnostic et la surveillance du SARS-CoV-2 dans la région de Transdanubie méridionale (3 comtés).
Contacts: gombos.katalin(at)pte.hu / urban.peter(at)pte.hu
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
Luxemburg
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
- Établissement public institué par la loi du 7 août 2012 et placé sous la supervision du ministère de la Santé au Luxembourg.
- Institut multidisciplinaire composé de 4 départements et de 2 centres nationaux :
- Centre national de pathologie
- Centre national de génétique
- Biologie médicale
- Microbiologie
- Médecine légale
- Protection de la santé
- Département de microbiologie : 3 services
- Bactériologie – mycologie – antibiorésistance et hygiène hospitalière
- Virologie et sérologie
- Séquençage des agents pathogènes : surveillance épidémiologique et génomique des agents pathogènes d’intérêt public
- Le département travaille en étroite collaboration avec le ministère de la Santé et l’ECDC pour soutenir la surveillance des agents pathogènes.
- Le département de microbiologie est désigné laboratoire national de référence pour les infections respiratoires aiguës, le VIH et les hépatites virales.
- Infrastructure du département : niveau de sécurité biologique 3
Contacts: Trung.Nguyen(at)lns.etat.lu / Megane.Migliorini(at)lns.etat.lu / Sabrina.Deroo(at)lns.etat.lu
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Łódź – Poland
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Le Laboratoire des virus respiratoires de l’Université de médecine de Łódź est situé à Łódź, en Pologne.
Notre laboratoire dispose des installations nécessaires à la mise en œuvre de méthodes biomoléculaires.
Il a été l’un des premiers laboratoires de référence en Pologne à obtenir l’autorisation de développer un test moléculaire de haute complexité pour le SARS-CoV-2.
L’organisme de tutelle national est l’Institut national d’hygiène, et notre laboratoire est directement rattaché à cet organisme central.
Contacts: izabela.drozdz(at)umed.lodz.pl / maciej.borowiec(at)umed.lodz.pl
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Lisbon – Portugal
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Diagnostic en laboratoire
- PCR multiplex (grippe, SARS-CoV-2, virus respiratoires)
- Culture virale (grippe, SARS-CoV-2)
- Sérologie : grippe (test d’inhibition de l’hémagglutination)
- SARS-CoV-2 (IgG anti-Spike, IgG anti-nuclécapside, IgM ; test immuno-chimioluminescent – Abbott)
- Système de détection rapide (WGS) de la grippe et du SARS-CoV-2
- Tests de sensibilité aux antiviraux : tests phénotypiques et génotypiques
Installations de laboratoire
- Niveaux de sécurité biologique 2 et 3
- Unité de culture virale ; Unité de bactéries respiratoires (TB, Legionella, Neisseria, Pneumo, Haemophilus)
Programme National de Surveillance de la Grippe et des autres Virus Respiratoires
Contacts: isabel.carvalho(at)insa.min-saude.pt / raquel.guiomar(at)insa.min-saude.pt / Nuno.Verdasca(at)insa.min-saude.pt
CCL – CASSOVIA COVID LAB
Kosice – Slovakia
CCL – CASSOVIA COVID LAB
- Laboratoire de diagnostic moléculaire accrédité pour la COVID-19
- Laboratoire universitaire, niveau de sécurité biologique 2
- Fait partie du réseau national de diagnostic de la COVID-19
- Lieu de travail commun à deux départements
- Département d’épidémiologie
- Département de biochimie médicale et clinique
- Autres méthodes de diagnostic : sérologie, séroneutralisation – uniquement dans le cadre de projets de recherche
- Le laboratoire de bactériologie est situé au sein du Département de microbiologie médicale et clinique
Contacts: monika.halanova(at)upjs.sk / miroslava.rabajdova(at)upjs.sk
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Madrid – Spain
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
L’hôpital universitaire de La Paz est un centre de soins tertiaires situé dans le nord de Madrid. Il accueille plus de 58 000 admissions et prend en charge plus de 1 500 000 patients externes par an. Le département de microbiologie clinique et de parasitologie de l’hôpital est divisé en plusieurs unités :
- Virologie
- Serologie
- Bacteriologie
- Mycologie
- Parasitologie
- Anesthésie des antibiotiques
- Séquençage de nouvelle génération
- Recherche et développement en microbiologie moléculaire
- Laboratoire de biosécurité (BSL-3)
Le département de microbiologie clinique et de parasitologie utilise des techniques de microbiologie classique et moléculaire, notamment la PCR, le séquençage du génome entier et la métagénomique. Il fait également partie du réseau national de surveillance des virus respiratoires, dont le SARS-CoV-2.
Contacts: eliedahdouh(at)gmail.com
Clinical Virology – University Hospital Basel
Basel – Switzerland
Clinical Virology – University Hospital Basel
Mission
L’Unité de Virologie Clinique de l’Hôpital Universitaire de Bâle propose une gamme complète d’analyses pour le diagnostic des maladies virales chez l’homme. Dévoués au développement et à la validation de nouvelles technologies et de tests spécialisés, nous collaborons étroitement avec des cliniciens et des partenaires universitaires afin de fournir des solutions diagnostiques fiables et de pointe pour les maladies infectieuses.
Surveillance nationale et Centre de référence de l’OMS
Dans le cadre de notre engagement en faveur de la santé publique, nous participons activement à des activités d’expertise, hébergeant les Centres de référence de l’OMS pour la polio et les entérovirus, ainsi que le Centre national de confirmation pour les tests diagnostiques du VIH. Désignés par l’Office fédéral de la santé publique suisse, nous apportons notre expertise sur la grippe et d’autres virus respiratoires, soutenant ainsi les efforts nationaux de surveillance et de riposte.
Installations de laboratoire et diagnostics
Nos capacités de laboratoire comprennent un large éventail de méthodes de diagnostic, telles que la PCR multiplex, la sérologie, la culture virale, les tests de sensibilité aux antiviraux (phénotypiques et génotypiques), le séquençage de nouvelle génération et le séquençage Nanopore de troisième génération. En combinant des technologies de pointe avec notre expertise et une solide collaboration avec des équipes cliniques et des chercheurs universitaires, nous nous efforçons de fournir des services de diagnostic de haute qualité et de contribuer à la surveillance et à la recherche sur les maladies infectieuses.
Contacts: karoline.leuzinger(a)usb.ch, rainer.gosert(a)usb.ch
