Pospeševanje in krepitev odziva na nove respiratorne viruse.
Mreža viroloških laboratorijev, ki uporabljajo isto tehniko za hitre, zanesljive in primerljive rezultate.
Za okrepitev naše pripravljenosti in odzivnosti na nove viruse je bil kot del poskusa Discovery in evropskega projekta EU-RESPONSE ustanovljen VIRvOLT (Virology Operational Laboratories for Drug Testing).
VIRvOLT, ki ga je razvil francoski nacionalni referenčni center (CNR) za okužbe z respiratornimi virusi v Hospices Civils de Lyon (HCL, Francija) v sodelovanju z bioMérieux, je strateško orodje za pripravo na zdravstvene krize.
Zdaj je integriran v evropski projekt PROACT EU-RESPONSE in krepi obstoječo klinično mrežo z dodajanjem operativnih viroloških laboratorijev na kraju samem.
Laboratoriji VIRvOLT omogočajo hitro merjenje standardiziranih virusnih obremenitev v vzorcih dihal in zagotavljajo primerljive rezultate, ne glede na uporabljeno molekularno platformo. Zahvaljujoč VIRvOLT in našim nenehnim prizadevanjem za uskladitev tehnik lahko kadar koli ocenimo virusno učinkovitost testiranih zdravljenj, za vmesne ali končne rezultate.
Enajst evropskih viroloških laboratorijev je uspešno zaključilo postopek validacije in se pridružilo mreži VIRvOLT. Izvajajo zunanjo oceno kakovosti in enkrat letno sodelujejo v delovni skupini. Cilj te mreže je vključiti nove partnerje in je trenutno v stiku z laboratoriji na Irskem, Norveškem in v Italiji.
Contacts
Nathalie Bergaud
Project manager
nathalie.bergaud01@chu-lyon.fr
Maude Bouscambert-Duchamp
Virologist
maude.bouscambert-duchamp@chu-lyon.fr
Alexandre Gaymard
Virologist
alexandre.gaymard@chu-lyon.fr
Evropska mreža viroloških laboratorijev
VIRvOLT – Mreža delujočih viroloških laboratorijev za vrednotenje zdravljenja
LHUB-ULB – Laboratoire Hospitalier Universitaire de Bruxelles
Brussels – Belgium
LHUB-ULB – Univerzitetni bolnišnični laboratorij v Bruslju
Mikrobiološki oddelek LHUB-ULB je odgovoren za laboratorijske analize, ki se izvajajo med preventivno, diagnostično in terapevtsko oskrbo bolnikov z nalezljivimi boleznimi. V tem kontekstu je naše poslanstvo zagotavljanje kakovostnih rezultatov v optimiziranem odzivnem času s spodbujanjem učinkovitosti, najsodobnejših tehnologij, strokovnega znanja in multidisciplinarnosti ter močnega sodelovanja s kliničnimi delavci naših partnerskih bolnišnic.
Mikrobiološki oddelek sestavlja 6 klinik in medicinskih enot ter svoje dejavnosti izvaja v vsakem od naših 4 centrov dejavnosti.
Mikrobiološki oddelek izvaja tudi strokovne dejavnosti na področju preučevanja in nadzora nekaterih okužb v Belgiji ter gosti 4 nacionalne referenčne centre (vrste Staphylococcus, vrste Campylobacter, Haemophilus influenza in vrste Legionella). Izvaja tudi raziskovalne projekte na področju diagnostike, epidemiologije in odpornosti na protiinfekcijska zdravila.
Contacts: Benoit.PREVOST(at)LHUB-ULB.BE
Faculty Hospital
Department of Clinical Microbiology and Immunology
Brno – Czech Republic
Oddelek za klinično mikrobiologijo in imunologijo fakultetne bolnišnice
Laboratorijska diagnostika
- Molekularna mikrobiologija (Multipleksna PCR – herpesvirusi, respiratorni, meningitis, gastrointestinalni, spolno prenosljive bolezni, HAV, HBV, HCV, HEV, borelioze, drugi)
- Bakteriologija, parazitologija, mikologija, odpornost na antibiotike
- Infekcijska imunologija (določanje protiteles proti različnim virusnim in bakterijskim povzročiteljem)
- Imunopatologija (določanje protiteles pri avtoimunskih boleznih, alergijah)
- BSL2 Laboratorijske enote
Contacts: Kaevska.Marija(at)fnbrno.cz / ZdrazilovaDubska.Lenka(at)fnbrno.cz / Mrkvicova.Martina(at)fnbrno.cz
CNR – National Reference Centre for viruses of infectious diseases
Lyon – France
CNR – Nacionalni referenčni center za viruse nalezljivih bolezni
Imenoval ga je ministrstvo, pristojno za zdravje, zlasti Generalni direktorat za zdravje (DGS) in Santé Publique France (SPF), za zagotavljanje strokovnega znanja o gripi in drugih respiratornih virusih.
Del Inštituta za povzročitelje okužb (IAI):
- Mikrobiološko strokovno znanje, vključno z virološkim strokovnim znanjem
- Molekularna biologija, virusne kulture, serologija, nevtralizacija seruma
- Dostop do objektov BSL 3
Misije
Nacionalni nadzor epidemiologije respiratornih virusov, ki temelji na več mrežah, ki zagotavljajo vzorce za analizo s strani CNR
- Splošni zdravniki
- Bolnišnični laboratoriji
- Zasebni laboratoriji
Nacionalni nadzor in upravljanje v primeru izrednih razmer
Virologists: maude.bouscambert-duchamp(at)chu-lyon.fr & alexandre.gaymard(at)chu-lyon.fr
Project Manager : nathalie.bergaud01(at)chu-lyon.fr
Evaggelismos General Hospital
Department of Clinical Microbiology
Athens – Greece
Oddelek za klinično mikrobiologijo Splošne bolnišnice Evaggelismos
Oddelek za klinično mikrobiologijo je bolnišnični laboratorij, ki pripada največji grški splošni bolnišnici v Atenah (Splošna bolnišnica Evaggelismos).
Oddelek je razdeljen na pododdelke:
- Oddelek za klasično bakteriologijo (krvokulture, urinske kulture, kulture respiratornih vzorcev itd., analiza MALDI-TOF, mikologija, parazitologija)
- Oddelek za serologijo (odkrivanje IgG, IgM, IgA in Ag z ELISA, IFA, CLIA itd.)
- Oddelek za antibiograme
- Oddelek za tuberkulozo
- Oddelek za molekularno diagnostiko (odkrivanje respiratornih virusov, herpesvirusov, poliomavirusov, parvovirusa B19 in protozojev, kot sta toksoplazma in leishmania, z metodami molekularne biologije. Molekularno epidemiološke študije za odkrivanje odpornosti pri nozokomialnih patogenih)
Oddelek je laboratorij BSL-2 in je del nacionalne mreže za diagnostično testiranje SARS-CoV-2.
Contact: ekraniot(at)yahoo.com
University of Pécs Clinical Center
Department of laboratory medicine – Unit of molecular genetics
Pécs – Hungary
Klinični center Univerze v Pécsu, Oddelek za laboratorijsko medicino – Enota za molekularno genetiko
- Klinični rutinski diagnostični laboratorij (največji ponudnik laboratorijskih diagnostičnih storitev v regiji Južna Podonavje). V našem laboratoriju izvajamo več kot 250 vrst testov, od katerih jih letno opravimo skoraj 2,5 milijona. Naš inštitut je laboratorij FJ-3, ki deluje neprekinjeno, 24 ur na dan.
- Enota za molekularno genetiko je laboratorij BSL-2, ki ima od leta 2016 akreditiran status za 15 molekularno diagnostičnih delovnih procesov testiranja s strani Nacionalnega akreditacijskega organa.
- Diagnostična paleta vključuje diagnostično testiranje bakterijskih in virusnih človeških patogenov na osnovi nukleinskih kislin ter avtomatizirano serološko testiranje (kvalitativna, kvantitativna in genotipna analiza HPV, Chlamydia trachomatis, Neisseria gonorrhoeae, Mycobacterium tuberculosis, virusa hepatitisa B in C, HSV 1/2, CMV, EBV, PB19 in SARS-CoV-2, detekcija protiteles IgM/IgG proti SARS-CoV-2 in protinukleokapsidi).
- Univerza v Pecsu je razvila bakteriološki laboratorij (kultivacija, serologija in analiza MALDI-TOF) na Oddelku za mikrobiologijo.
- Laboratorijska enota je akreditirana tudi za genetsko testiranje faktorja II in faktorja V, MTHFR, APOE ter mutacij in polimorfizmov genov za odpornost na več zdravil (MDR).
- Madžarski nacionalni sklad za zdravstveno zavarovanje (NEAK) imenuje laboratorijske enote za testiranje patogenov, če diagnostične ali nadzorne potrebe po testiranju presegajo zmogljivosti centralnega laboratorija Nacionalnega centra za epidemiologijo. Univerza v Pecsu je imenovana za diagnostiko in nadzor SARS-CoV-2 v južnopodonavski regiji (3 okrožja).
Contacts: gombos.katalin(at)pte.hu / urban.peter(at)pte.hu
LNS – Laboratoire national de Santé – Department of microbiology
Luxemburg
LNS – Nacionalni laboratorij za zdravje – Oddelek za mikrobiologijo
- Javni zavod, ustanovljen z zakonom z dne 7. avgusta 2012, ki deluje pod nadzorom Ministrstva za zdravje v Luksemburgu
- Multidisciplinarni inštitut s 4 oddelki in 2 nacionalnima centroma:
- Nacionalni center za patologijo
- Nacionalni center za genetiko
- Medicinska biologija
- Mikrobiologija
- Sodna medicina
- Varovanje zdravja
- Oddelek za mikrobiologijo: 3 storitve
- Bakteriologija – mikologija – odpornost na antibiotike in bolnišnična higiena
- Virologija in serologija
- Sekvenciranje patogenov: epidemiološko in genomsko spremljanje patogenov javnega interesa
- Oddelek tesno sodeluje z Ministrstvom za zdravje (MoH) in ECDC pri podpori nadzora patogenov
- Oddelek za mikrobiologijo je imenovan za Nacionalni referenčni laboratorij za akutne okužbe dihal, HIV in virusni hepatitis
- Infrastruktura v oddelku: BSL-3
Contacts: Trung.Nguyen(at)lns.etat.lu / Megane.Migliorini(at)lns.etat.lu / Sabrina.Deroo(at)lns.etat.lu
Respiratory Virus Laboratory of the Medical University of Łódź
Łódź – Poland
Laboratorij za respiratorne viruse Medicinske univerze v Lodžu
Laboratorij za respiratorne viruse Medicinske univerze v Lodžu se nahaja v Lodžu na Poljskem.
Naš laboratorij ima zmogljivosti za izvajanje biomolekularnih metodologij.
Laboratorij je bil eden prvih referenčnih laboratorijev na Poljskem, ki je prejel dovoljenje za visoko kompleksen molekularno zasnovan test SARS CoV-2, razvit v laboratoriju.
Nadzorni organ na nacionalni ravni je Nacionalni inštitut za higieno, naš laboratorij pa je neposredno podrejen zgoraj omenjeni centralni instituciji.
Contacts: izabela.drozdz(at)umed.lodz.pl / maciej.borowiec(at)umed.lodz.pl
INSA – National Reference Laboratory for Influenza and other Respiratory Viruses
Lisbon – Portugal
INSA – Nacionalni referenčni laboratorij za gripo in druge respiratorne viruse
laboratorijska diagnostika
- Multipleksna PCR (gripa, SARS-CoV-2, respiratorni virus)
- Kultura virusa (gripa, SARS-CoV-2)
- Serologija: Gripa (test inhibicije hemaglutinacije) assay)
- SARS-CoV-2 (IgG anti-Spike, IgG anti-nuklokapsid, IgM; imunokemioluminiscenčni test – Abbott)
- WGS Gripa in SARS-CoV-2
- Test občutljivosti na protivirusna zdravila: fenotipski in genotipski testi
Laboratorijski prostori
- BSL2 in BSL3
- Enota za virusne kulture; Enota za respiratorne bakterije (TB, Legionela, Neisseria, Pneumo, Haemophilus)
Nacionalni program nadzora za gripo in druge respiratorne viruse
Contacts: isabel.carvalho(at)insa.min-saude.pt / raquel.guiomar(at)insa.min-saude.pt / Nuno.Verdasca(at)insa.min-saude.pt
CCL – CASSOVIA COVID LAB
Kosice – Slovakia
CCL – CASSOVIA COVID LAB
- Akreditirani laboratorij za molekularno diagnostiko COVID-19
- Univerzitetni laboratorij, laboratorij BSL-2
- Del nacionalne mreže za diagnostiko COVID-19
- Skupno delovno mesto dveh oddelkov
- Oddelek za epidemiologijo
- Oddelek za medicinsko in klinično biokemijo
- Druge diagnostične metode: serologija, serum nevtralizacijska analiza – samo v okviru raziskovalnih projektov
- Bakteriološki laboratorij se nahaja na Oddelku za medicinsko in klinično mikrobiologijo
Contacts: monika.halanova(at)upjs.sk / miroslava.rabajdova(at)upjs.sk
Servicio de microbiologia
Hospital La Paz
Madrid – Spain
Mikrobiološka služba, bolnišnica La Paz
Univerzitetna bolnišnica La Paz je terciarni center zdravstvene oskrbe na območju severnega Madrida, ki letno sprejme več kot 58.000 bolnikov in oskrbi več kot 1.500.000 ambulantnih bolnikov. Oddelek za klinično mikrobiologijo in parazitologijo bolnišnice je funkcionalno razdeljen na več enot, ki vključujejo:
- Virusologijo
- Serologijo
- Bakteriologijo
- Mikologijo
- Parazitologijo
- Testiranje občutljivosti na antibiotike
- Sekvenciranje naslednje generacije
- Raziskave in razvoj molekularne mikrobiologije
- Laboratorij BSL-3
Oddelek za klinično mikrobiologijo in parazitologijo uporablja tako klasične kot molekularno mikrobiološke tehnike, ki vključujejo PCR, sekvenciranje celotnega genoma in metagenomiko. Oddelek je tudi del nacionalne mreže za nadzor respiratornih virusov, vključno s SARS-CoV-2.
Contacts: eliedahdouh(at)gmail.com
Clinical Virology – University Hospital Basel
Basel – Switzerland
Klinična virologija – Univerzitetna bolnišnica Basel
Poslanstvo
Enota za klinično virologijo v Univerzitetni bolnišnici Basel ponuja celovit nabor analiz za diagnosticiranje virusnih bolezni pri ljudeh. Predani smo napredku in potrjevanju novih tehnologij in specializiranih testov ter tesno sodelujemo s kliničnimi zdravniki in akademskimi partnerji, da bi zagotovili zanesljive in najsodobnejše diagnostične rešitve za nalezljive bolezni.
Nacionalni center za nadzor in referenčni center SZO
V naši zavezanosti javnemu zdravju se aktivno ukvarjamo s strokovnimi dejavnostmi, saj gostimo referenčne centre SZO za polio in enteroviruse ter nacionalni potrditveni center za diagnostično testiranje HIV. Imenovani s strani Zveznega urada za javno zdravje Švice, nudimo strokovno znanje o gripi in drugih respiratornih virusih ter podpiramo nacionalna prizadevanja za nadzor in odzivanje.
Laboratorijski prostori in diagnostika
Naše laboratorijske zmogljivosti vključujejo široko paleto diagnostičnih metod, kot so multipleksno PCR testiranje, serologija, virusna kultura, testiranje občutljivosti na protivirusna zdravila (fenotipsko in genotipsko), sekvenciranje naslednje generacije in sekvenciranje Nanopore tretje generacije. Z združevanjem
Contacts: karoline.leuzinger(a)usb.ch, rainer.gosert(a)usb.ch
